Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SKOR1P84550 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SKOR1P84550 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SKOR1P84550 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SKOR1P84550 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SKOR1P84550 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SKOR1P84550 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SKOR1P84550 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SKOR1P84550 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SKOR1P84550 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SKOR1P84550 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SKOR1P84550 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SKOR1P84550 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SKOR1P84550 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SKOR1P84550 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SKOR1P84550 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SKOR1P84550 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SKOR1P84550 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SKOR1P84550 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SKOR1P84550 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SKOR1P84550 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SKOR1P84550 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SKOR1P84550 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SKOR1P84550 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SKOR1P84550 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SKOR1P84550 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SKOR1P84550 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SKOR1P84550 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SKOR1P84550 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SKOR1P84550 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SKOR1P84550 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SKOR1P84550 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SKOR1P84550 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SKOR1P84550 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SKOR1P84550 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SKOR1P84550 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SKOR1P84550 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SKOR1P84550 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SKOR1P84550 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SKOR1P84550 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SKOR1P84550 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SKOR1P84550 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SKOR1P84550 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SKOR1P84550 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SKOR1P84550 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SKOR1P84550 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SKOR1P84550 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SKOR1P84550 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SKOR1P84550 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SKOR1P84550 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SKOR1P84550 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SKOR1P84550 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SKOR1P84550 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SKOR1P84550 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.54■■■□□ 2
SKOR1P84550 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SKOR1P84550 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SKOR1P84550 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SKOR1P84550 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SKOR1P84550 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SKOR1P84550 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SKOR1P84550 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SKOR1P84550 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SKOR1P84550 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SKOR1P84550 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SKOR1P84550 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SKOR1P84550 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SKOR1P84550 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SKOR1P84550 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SKOR1P84550 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SKOR1P84550 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SKOR1P84550 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SKOR1P84550 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SKOR1P84550 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SKOR1P84550 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SKOR1P84550 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SKOR1P84550 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SKOR1P84550 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SKOR1P84550 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SKOR1P84550 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SKOR1P84550 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SKOR1P84550 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SKOR1P84550 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SKOR1P84550 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SKOR1P84550 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SKOR1P84550 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SKOR1P84550 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SKOR1P84550 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SKOR1P84550 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SKOR1P84550 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKOR1P84550 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKOR1P84550 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKOR1P84550 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SKOR1P84550 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKOR1P84550 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKOR1P84550 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SKOR1P84550 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SKOR1P84550 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SKOR1P84550 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SKOR1P84550 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SKOR1P84550 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms