Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS28P62857 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS28P62857 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS28P62857 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS28P62857 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS28P62857 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS28P62857 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS28P62857 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS28P62857 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS28P62857 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS28P62857 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPS28P62857 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPS28P62857 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS28P62857 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS28P62857 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS28P62857 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS28P62857 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS28P62857 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS28P62857 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS28P62857 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS28P62857 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS28P62857 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS28P62857 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS28P62857 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS28P62857 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS28P62857 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS28P62857 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS28P62857 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS28P62857 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS28P62857 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS28P62857 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS28P62857 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS28P62857 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS28P62857 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS28P62857 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS28P62857 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS28P62857 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS28P62857 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS28P62857 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS28P62857 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS28P62857 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS28P62857 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS28P62857 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS28P62857 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS28P62857 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS28P62857 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS28P62857 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS28P62857 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS28P62857 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS28P62857 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS28P62857 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS28P62857 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS28P62857 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS28P62857 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS28P62857 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS28P62857 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS28P62857 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPS28P62857 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS28P62857 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS28P62857 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS28P62857 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS28P62857 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS28P62857 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPS28P62857 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPS28P62857 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RPS28P62857 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPS28P62857 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS28P62857 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS28P62857 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS28P62857 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS28P62857 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS28P62857 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS28P62857 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS28P62857 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS28P62857 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS28P62857 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS28P62857 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS28P62857 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS28P62857 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPS28P62857 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS28P62857 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS28P62857 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS28P62857 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS28P62857 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS28P62857 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS28P62857 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS28P62857 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS28P62857 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS28P62857 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS28P62857 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS28P62857 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS28P62857 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS28P62857 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS28P62857 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS28P62857 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS28P62857 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS28P62857 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS28P62857 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS28P62857 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS28P62857 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms