Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF6P62330 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF6P62330 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARF6P62330 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARF6P62330 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARF6P62330 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARF6P62330 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARF6P62330 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARF6P62330 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARF6P62330 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARF6P62330 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARF6P62330 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARF6P62330 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARF6P62330 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARF6P62330 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARF6P62330 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARF6P62330 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARF6P62330 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARF6P62330 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ARF6P62330 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARF6P62330 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARF6P62330 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARF6P62330 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARF6P62330 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARF6P62330 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARF6P62330 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARF6P62330 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARF6P62330 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARF6P62330 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARF6P62330 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARF6P62330 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARF6P62330 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARF6P62330 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARF6P62330 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARF6P62330 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARF6P62330 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARF6P62330 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARF6P62330 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARF6P62330 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARF6P62330 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARF6P62330 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARF6P62330 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARF6P62330 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARF6P62330 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARF6P62330 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARF6P62330 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARF6P62330 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARF6P62330 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARF6P62330 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARF6P62330 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARF6P62330 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARF6P62330 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARF6P62330 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF6P62330 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF6P62330 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF6P62330 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARF6P62330 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARF6P62330 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARF6P62330 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARF6P62330 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARF6P62330 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARF6P62330 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARF6P62330 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARF6P62330 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARF6P62330 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARF6P62330 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARF6P62330 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARF6P62330 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARF6P62330 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARF6P62330 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARF6P62330 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARF6P62330 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARF6P62330 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARF6P62330 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARF6P62330 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARF6P62330 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARF6P62330 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARF6P62330 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ARF6P62330 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARF6P62330 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARF6P62330 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARF6P62330 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF6P62330 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF6P62330 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF6P62330 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF6P62330 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF6P62330 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF6P62330 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF6P62330 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF6P62330 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF6P62330 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF6P62330 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF6P62330 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF6P62330 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF6P62330 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF6P62330 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF6P62330 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARF6P62330 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARF6P62330 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARF6P62330 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.8 ms