Protein–RNA interactions for Protein: P62079

TSPAN5, Tetraspanin-5, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN5P62079 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN5P62079 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN5P62079 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN5P62079 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN5P62079 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN5P62079 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN5P62079 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN5P62079 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN5P62079 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN5P62079 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN5P62079 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN5P62079 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN5P62079 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN5P62079 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN5P62079 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN5P62079 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN5P62079 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN5P62079 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN5P62079 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN5P62079 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN5P62079 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN5P62079 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN5P62079 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN5P62079 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN5P62079 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSPAN5P62079 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN5P62079 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN5P62079 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN5P62079 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN5P62079 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN5P62079 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN5P62079 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN5P62079 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN5P62079 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN5P62079 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN5P62079 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN5P62079 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN5P62079 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN5P62079 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN5P62079 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN5P62079 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN5P62079 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN5P62079 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN5P62079 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN5P62079 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSPAN5P62079 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSPAN5P62079 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TSPAN5P62079 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN5P62079 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN5P62079 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN5P62079 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN5P62079 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN5P62079 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN5P62079 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN5P62079 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN5P62079 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN5P62079 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN5P62079 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN5P62079 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN5P62079 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN5P62079 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN5P62079 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN5P62079 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN5P62079 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN5P62079 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN5P62079 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TSPAN5P62079 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN5P62079 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN5P62079 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN5P62079 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN5P62079 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN5P62079 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN5P62079 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN5P62079 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN5P62079 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN5P62079 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN5P62079 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN5P62079 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN5P62079 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN5P62079 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TSPAN5P62079 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN5P62079 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN5P62079 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN5P62079 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN5P62079 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN5P62079 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN5P62079 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN5P62079 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN5P62079 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN5P62079 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN5P62079 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN5P62079 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN5P62079 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN5P62079 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN5P62079 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN5P62079 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN5P62079 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN5P62079 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN5P62079 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN5P62079 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms