Protein–RNA interactions for Protein: P60891

PRPS1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1P60891 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPS1P60891 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPS1P60891 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPS1P60891 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPS1P60891 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPS1P60891 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPS1P60891 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPS1P60891 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPS1P60891 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPS1P60891 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPS1P60891 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPS1P60891 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPS1P60891 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPS1P60891 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPS1P60891 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPS1P60891 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPS1P60891 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPS1P60891 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPS1P60891 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPS1P60891 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPS1P60891 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPS1P60891 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPS1P60891 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPS1P60891 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPS1P60891 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPS1P60891 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPS1P60891 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPS1P60891 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPS1P60891 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPS1P60891 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRPS1P60891 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPS1P60891 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPS1P60891 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPS1P60891 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPS1P60891 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPS1P60891 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPS1P60891 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPS1P60891 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPS1P60891 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPS1P60891 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPS1P60891 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPS1P60891 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPS1P60891 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPS1P60891 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPS1P60891 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRPS1P60891 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPS1P60891 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPS1P60891 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPS1P60891 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPS1P60891 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPS1P60891 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPS1P60891 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPS1P60891 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPS1P60891 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPS1P60891 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPS1P60891 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPS1P60891 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPS1P60891 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPS1P60891 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPS1P60891 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPS1P60891 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPS1P60891 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPS1P60891 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPS1P60891 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPS1P60891 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPS1P60891 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPS1P60891 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPS1P60891 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPS1P60891 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPS1P60891 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPS1P60891 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPS1P60891 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPS1P60891 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPS1P60891 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPS1P60891 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPS1P60891 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPS1P60891 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPS1P60891 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPS1P60891 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPS1P60891 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPS1P60891 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPS1P60891 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPS1P60891 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPS1P60891 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPS1P60891 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPS1P60891 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPS1P60891 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPS1P60891 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPS1P60891 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPS1P60891 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRPS1P60891 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPS1P60891 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPS1P60891 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPS1P60891 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPS1P60891 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPS1P60891 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPS1P60891 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPS1P60891 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPS1P60891 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPS1P60891 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms