Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LOXL3P58215 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LOXL3P58215 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LOXL3P58215 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LOXL3P58215 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LOXL3P58215 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LOXL3P58215 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LOXL3P58215 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LOXL3P58215 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LOXL3P58215 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LOXL3P58215 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LOXL3P58215 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LOXL3P58215 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LOXL3P58215 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LOXL3P58215 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LOXL3P58215 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LOXL3P58215 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LOXL3P58215 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LOXL3P58215 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LOXL3P58215 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LOXL3P58215 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LOXL3P58215 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LOXL3P58215 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LOXL3P58215 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LOXL3P58215 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LOXL3P58215 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LOXL3P58215 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LOXL3P58215 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LOXL3P58215 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LOXL3P58215 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LOXL3P58215 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LOXL3P58215 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LOXL3P58215 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LOXL3P58215 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LOXL3P58215 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LOXL3P58215 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LOXL3P58215 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LOXL3P58215 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LOXL3P58215 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LOXL3P58215 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LOXL3P58215 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LOXL3P58215 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LOXL3P58215 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LOXL3P58215 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LOXL3P58215 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LOXL3P58215 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LOXL3P58215 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LOXL3P58215 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LOXL3P58215 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LOXL3P58215 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LOXL3P58215 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LOXL3P58215 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LOXL3P58215 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LOXL3P58215 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LOXL3P58215 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LOXL3P58215 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LOXL3P58215 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LOXL3P58215 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LOXL3P58215 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LOXL3P58215 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LOXL3P58215 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LOXL3P58215 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LOXL3P58215 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LOXL3P58215 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LOXL3P58215 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LOXL3P58215 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LOXL3P58215 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LOXL3P58215 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LOXL3P58215 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXL3P58215 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXL3P58215 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXL3P58215 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXL3P58215 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXL3P58215 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXL3P58215 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LOXL3P58215 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LOXL3P58215 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LOXL3P58215 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LOXL3P58215 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LOXL3P58215 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LOXL3P58215 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LOXL3P58215 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LOXL3P58215 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LOXL3P58215 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LOXL3P58215 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LOXL3P58215 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LOXL3P58215 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LOXL3P58215 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LOXL3P58215 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LOXL3P58215 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LOXL3P58215 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LOXL3P58215 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LOXL3P58215 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LOXL3P58215 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LOXL3P58215 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LOXL3P58215 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LOXL3P58215 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LOXL3P58215 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LOXL3P58215 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LOXL3P58215 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms