Protein–RNA interactions for Protein: P57678

GEMIN4, Gem-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMIN4P57678 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GEMIN4P57678 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GEMIN4P57678 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GEMIN4P57678 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GEMIN4P57678 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GEMIN4P57678 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GEMIN4P57678 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GEMIN4P57678 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GEMIN4P57678 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GEMIN4P57678 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GEMIN4P57678 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GEMIN4P57678 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GEMIN4P57678 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GEMIN4P57678 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GEMIN4P57678 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GEMIN4P57678 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GEMIN4P57678 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GEMIN4P57678 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GEMIN4P57678 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GEMIN4P57678 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GEMIN4P57678 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GEMIN4P57678 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GEMIN4P57678 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GEMIN4P57678 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GEMIN4P57678 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GEMIN4P57678 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GEMIN4P57678 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GEMIN4P57678 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GEMIN4P57678 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GEMIN4P57678 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GEMIN4P57678 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GEMIN4P57678 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GEMIN4P57678 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GEMIN4P57678 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GEMIN4P57678 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GEMIN4P57678 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GEMIN4P57678 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GEMIN4P57678 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GEMIN4P57678 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GEMIN4P57678 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GEMIN4P57678 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GEMIN4P57678 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GEMIN4P57678 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GEMIN4P57678 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GEMIN4P57678 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GEMIN4P57678 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GEMIN4P57678 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GEMIN4P57678 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GEMIN4P57678 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GEMIN4P57678 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GEMIN4P57678 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GEMIN4P57678 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GEMIN4P57678 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GEMIN4P57678 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GEMIN4P57678 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GEMIN4P57678 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GEMIN4P57678 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GEMIN4P57678 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GEMIN4P57678 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GEMIN4P57678 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GEMIN4P57678 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GEMIN4P57678 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GEMIN4P57678 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GEMIN4P57678 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GEMIN4P57678 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GEMIN4P57678 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GEMIN4P57678 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GEMIN4P57678 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GEMIN4P57678 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GEMIN4P57678 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GEMIN4P57678 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GEMIN4P57678 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GEMIN4P57678 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GEMIN4P57678 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GEMIN4P57678 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GEMIN4P57678 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GEMIN4P57678 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GEMIN4P57678 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GEMIN4P57678 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GEMIN4P57678 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GEMIN4P57678 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GEMIN4P57678 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GEMIN4P57678 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GEMIN4P57678 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GEMIN4P57678 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GEMIN4P57678 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GEMIN4P57678 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GEMIN4P57678 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GEMIN4P57678 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GEMIN4P57678 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GEMIN4P57678 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GEMIN4P57678 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GEMIN4P57678 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GEMIN4P57678 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GEMIN4P57678 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GEMIN4P57678 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GEMIN4P57678 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GEMIN4P57678 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GEMIN4P57678 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GEMIN4P57678 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms