Protein–RNA interactions for Protein: P56381

ATP5E, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5EP56381 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5EP56381 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5EP56381 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP5EP56381 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP5EP56381 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP5EP56381 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5EP56381 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5EP56381 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5EP56381 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5EP56381 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5EP56381 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5EP56381 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5EP56381 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5EP56381 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5EP56381 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5EP56381 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5EP56381 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5EP56381 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5EP56381 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5EP56381 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5EP56381 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5EP56381 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5EP56381 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5EP56381 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5EP56381 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5EP56381 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5EP56381 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5EP56381 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5EP56381 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5EP56381 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5EP56381 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5EP56381 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5EP56381 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5EP56381 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5EP56381 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5EP56381 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5EP56381 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5EP56381 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5EP56381 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5EP56381 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5EP56381 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5EP56381 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5EP56381 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5EP56381 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5EP56381 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5EP56381 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5EP56381 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5EP56381 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5EP56381 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5EP56381 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5EP56381 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5EP56381 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5EP56381 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5EP56381 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5EP56381 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5EP56381 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5EP56381 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5EP56381 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5EP56381 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5EP56381 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5EP56381 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5EP56381 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5EP56381 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5EP56381 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5EP56381 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5EP56381 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5EP56381 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5EP56381 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5EP56381 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5EP56381 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5EP56381 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5EP56381 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5EP56381 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5EP56381 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5EP56381 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5EP56381 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5EP56381 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5EP56381 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5EP56381 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5EP56381 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5EP56381 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5EP56381 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5EP56381 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5EP56381 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5EP56381 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5EP56381 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5EP56381 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5EP56381 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5EP56381 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5EP56381 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5EP56381 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5EP56381 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5EP56381 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5EP56381 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5EP56381 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5EP56381 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5EP56381 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP5EP56381 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5EP56381 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5EP56381 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms