Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COPAP53621 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COPAP53621 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COPAP53621 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COPAP53621 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COPAP53621 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COPAP53621 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COPAP53621 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COPAP53621 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COPAP53621 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COPAP53621 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COPAP53621 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COPAP53621 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COPAP53621 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COPAP53621 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COPAP53621 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COPAP53621 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COPAP53621 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COPAP53621 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
COPAP53621 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COPAP53621 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COPAP53621 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COPAP53621 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COPAP53621 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COPAP53621 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COPAP53621 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COPAP53621 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COPAP53621 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COPAP53621 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COPAP53621 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COPAP53621 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COPAP53621 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COPAP53621 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COPAP53621 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COPAP53621 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COPAP53621 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COPAP53621 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COPAP53621 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COPAP53621 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COPAP53621 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COPAP53621 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COPAP53621 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COPAP53621 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COPAP53621 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COPAP53621 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COPAP53621 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COPAP53621 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COPAP53621 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COPAP53621 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COPAP53621 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COPAP53621 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COPAP53621 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COPAP53621 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COPAP53621 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COPAP53621 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COPAP53621 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COPAP53621 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COPAP53621 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COPAP53621 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COPAP53621 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COPAP53621 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COPAP53621 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COPAP53621 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COPAP53621 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
COPAP53621 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COPAP53621 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COPAP53621 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COPAP53621 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COPAP53621 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COPAP53621 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COPAP53621 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COPAP53621 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COPAP53621 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COPAP53621 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COPAP53621 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COPAP53621 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COPAP53621 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COPAP53621 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
COPAP53621 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COPAP53621 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COPAP53621 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
COPAP53621 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COPAP53621 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COPAP53621 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPAP53621 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COPAP53621 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COPAP53621 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COPAP53621 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COPAP53621 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COPAP53621 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COPAP53621 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
COPAP53621 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COPAP53621 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COPAP53621 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COPAP53621 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27■■□□□ 1.91
COPAP53621 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COPAP53621 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COPAP53621 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
COPAP53621 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COPAP53621 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms