Protein–RNA interactions for Protein: P51684

CCR6, C-C chemokine receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6P51684 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR6P51684 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR6P51684 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR6P51684 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR6P51684 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR6P51684 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR6P51684 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR6P51684 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR6P51684 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR6P51684 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR6P51684 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR6P51684 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR6P51684 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR6P51684 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR6P51684 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR6P51684 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR6P51684 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR6P51684 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR6P51684 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR6P51684 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR6P51684 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR6P51684 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR6P51684 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR6P51684 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR6P51684 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR6P51684 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR6P51684 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR6P51684 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR6P51684 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR6P51684 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR6P51684 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR6P51684 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR6P51684 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR6P51684 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR6P51684 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR6P51684 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR6P51684 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR6P51684 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR6P51684 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR6P51684 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR6P51684 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR6P51684 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR6P51684 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR6P51684 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR6P51684 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR6P51684 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR6P51684 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR6P51684 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR6P51684 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR6P51684 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR6P51684 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR6P51684 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR6P51684 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR6P51684 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR6P51684 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR6P51684 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR6P51684 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR6P51684 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCR6P51684 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR6P51684 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR6P51684 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR6P51684 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR6P51684 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR6P51684 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR6P51684 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR6P51684 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR6P51684 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR6P51684 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR6P51684 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR6P51684 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR6P51684 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR6P51684 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR6P51684 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR6P51684 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR6P51684 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR6P51684 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCR6P51684 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR6P51684 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR6P51684 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR6P51684 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR6P51684 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR6P51684 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR6P51684 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR6P51684 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR6P51684 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR6P51684 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR6P51684 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR6P51684 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR6P51684 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR6P51684 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR6P51684 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR6P51684 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR6P51684 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR6P51684 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR6P51684 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR6P51684 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR6P51684 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR6P51684 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR6P51684 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR6P51684 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms