Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BRCA2P51587 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BRCA2P51587 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BRCA2P51587 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
BRCA2P51587 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BRCA2P51587 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
BRCA2P51587 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
BRCA2P51587 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
BRCA2P51587 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
BRCA2P51587 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
BRCA2P51587 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
BRCA2P51587 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
BRCA2P51587 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
BRCA2P51587 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
BRCA2P51587 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
BRCA2P51587 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
BRCA2P51587 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
BRCA2P51587 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
BRCA2P51587 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
BRCA2P51587 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
BRCA2P51587 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
BRCA2P51587 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
BRCA2P51587 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
BRCA2P51587 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
BRCA2P51587 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
BRCA2P51587 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
BRCA2P51587 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
BRCA2P51587 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
BRCA2P51587 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BRCA2P51587 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BRCA2P51587 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BRCA2P51587 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
BRCA2P51587 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
BRCA2P51587 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BRCA2P51587 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BRCA2P51587 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BRCA2P51587 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BRCA2P51587 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BRCA2P51587 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
BRCA2P51587 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BRCA2P51587 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
BRCA2P51587 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BRCA2P51587 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
BRCA2P51587 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
BRCA2P51587 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
BRCA2P51587 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
BRCA2P51587 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
BRCA2P51587 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
BRCA2P51587 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
BRCA2P51587 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BRCA2P51587 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
BRCA2P51587 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
BRCA2P51587 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BRCA2P51587 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BRCA2P51587 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
BRCA2P51587 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
BRCA2P51587 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BRCA2P51587 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BRCA2P51587 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BRCA2P51587 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BRCA2P51587 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
BRCA2P51587 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
BRCA2P51587 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
BRCA2P51587 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
BRCA2P51587 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
BRCA2P51587 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
BRCA2P51587 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
BRCA2P51587 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
BRCA2P51587 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
BRCA2P51587 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
BRCA2P51587 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
BRCA2P51587 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
BRCA2P51587 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
BRCA2P51587 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BRCA2P51587 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
BRCA2P51587 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
BRCA2P51587 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BRCA2P51587 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
BRCA2P51587 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BRCA2P51587 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BRCA2P51587 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BRCA2P51587 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BRCA2P51587 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BRCA2P51587 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
BRCA2P51587 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BRCA2P51587 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
BRCA2P51587 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
BRCA2P51587 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
BRCA2P51587 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
BRCA2P51587 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
BRCA2P51587 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
BRCA2P51587 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
BRCA2P51587 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
BRCA2P51587 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
BRCA2P51587 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
BRCA2P51587 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
BRCA2P51587 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
BRCA2P51587 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
BRCA2P51587 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
BRCA2P51587 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms