Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
MRE11P49959 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
MRE11P49959 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
MRE11P49959 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
MRE11P49959 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MRE11P49959 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MRE11P49959 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
MRE11P49959 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MRE11P49959 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
MRE11P49959 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
MRE11P49959 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
MRE11P49959 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
MRE11P49959 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
MRE11P49959 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
MRE11P49959 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
MRE11P49959 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
MRE11P49959 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
MRE11P49959 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
MRE11P49959 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
MRE11P49959 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
MRE11P49959 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
MRE11P49959 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
MRE11P49959 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
MRE11P49959 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
MRE11P49959 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
MRE11P49959 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
MRE11P49959 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
MRE11P49959 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
MRE11P49959 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
MRE11P49959 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
MRE11P49959 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
MRE11P49959 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
MRE11P49959 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
MRE11P49959 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
MRE11P49959 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
MRE11P49959 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
MRE11P49959 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
MRE11P49959 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
MRE11P49959 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
MRE11P49959 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
MRE11P49959 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
MRE11P49959 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
MRE11P49959 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
MRE11P49959 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
MRE11P49959 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
MRE11P49959 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
MRE11P49959 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
MRE11P49959 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
MRE11P49959 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
MRE11P49959 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
MRE11P49959 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
MRE11P49959 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
MRE11P49959 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
MRE11P49959 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
MRE11P49959 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
MRE11P49959 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MRE11P49959 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
MRE11P49959 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
MRE11P49959 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
MRE11P49959 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
MRE11P49959 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
MRE11P49959 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
MRE11P49959 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
MRE11P49959 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
MRE11P49959 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MRE11P49959 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MRE11P49959 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
MRE11P49959 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
MRE11P49959 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MRE11P49959 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MRE11P49959 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MRE11P49959 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
MRE11P49959 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
MRE11P49959 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
MRE11P49959 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
MRE11P49959 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
MRE11P49959 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
MRE11P49959 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MRE11P49959 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
MRE11P49959 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
MRE11P49959 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MRE11P49959 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MRE11P49959 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
MRE11P49959 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MRE11P49959 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
MRE11P49959 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MRE11P49959 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MRE11P49959 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MRE11P49959 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MRE11P49959 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MRE11P49959 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MRE11P49959 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MRE11P49959 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MRE11P49959 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MRE11P49959 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MRE11P49959 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MRE11P49959 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MRE11P49959 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
MRE11P49959 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MRE11P49959 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms