Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLK1P49759 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLK1P49759 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLK1P49759 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLK1P49759 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLK1P49759 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLK1P49759 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLK1P49759 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLK1P49759 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLK1P49759 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLK1P49759 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLK1P49759 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLK1P49759 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLK1P49759 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CLK1P49759 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLK1P49759 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CLK1P49759 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLK1P49759 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLK1P49759 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLK1P49759 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLK1P49759 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLK1P49759 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLK1P49759 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLK1P49759 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLK1P49759 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLK1P49759 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLK1P49759 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLK1P49759 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLK1P49759 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLK1P49759 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLK1P49759 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLK1P49759 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLK1P49759 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLK1P49759 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLK1P49759 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLK1P49759 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLK1P49759 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLK1P49759 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLK1P49759 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLK1P49759 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLK1P49759 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLK1P49759 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLK1P49759 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLK1P49759 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLK1P49759 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLK1P49759 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CLK1P49759 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLK1P49759 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CLK1P49759 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLK1P49759 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLK1P49759 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLK1P49759 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLK1P49759 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLK1P49759 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLK1P49759 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLK1P49759 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLK1P49759 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK1P49759 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK1P49759 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK1P49759 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK1P49759 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK1P49759 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLK1P49759 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLK1P49759 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLK1P49759 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLK1P49759 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLK1P49759 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLK1P49759 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLK1P49759 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLK1P49759 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLK1P49759 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLK1P49759 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLK1P49759 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLK1P49759 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLK1P49759 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLK1P49759 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLK1P49759 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLK1P49759 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLK1P49759 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLK1P49759 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLK1P49759 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLK1P49759 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLK1P49759 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLK1P49759 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLK1P49759 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLK1P49759 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLK1P49759 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLK1P49759 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLK1P49759 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLK1P49759 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLK1P49759 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLK1P49759 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLK1P49759 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLK1P49759 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLK1P49759 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLK1P49759 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLK1P49759 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLK1P49759 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLK1P49759 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLK1P49759 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 318.7 ms