Protein–RNA interactions for Protein: P49643

PRIM2, DNA primase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM2P49643 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRIM2P49643 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRIM2P49643 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRIM2P49643 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRIM2P49643 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRIM2P49643 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRIM2P49643 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRIM2P49643 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRIM2P49643 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRIM2P49643 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRIM2P49643 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRIM2P49643 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRIM2P49643 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRIM2P49643 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRIM2P49643 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRIM2P49643 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRIM2P49643 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRIM2P49643 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRIM2P49643 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRIM2P49643 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRIM2P49643 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRIM2P49643 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRIM2P49643 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRIM2P49643 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRIM2P49643 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRIM2P49643 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRIM2P49643 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRIM2P49643 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRIM2P49643 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRIM2P49643 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRIM2P49643 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRIM2P49643 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRIM2P49643 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRIM2P49643 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRIM2P49643 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRIM2P49643 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRIM2P49643 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRIM2P49643 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRIM2P49643 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRIM2P49643 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRIM2P49643 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM2P49643 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM2P49643 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM2P49643 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM2P49643 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM2P49643 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRIM2P49643 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRIM2P49643 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRIM2P49643 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRIM2P49643 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRIM2P49643 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRIM2P49643 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRIM2P49643 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRIM2P49643 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRIM2P49643 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRIM2P49643 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRIM2P49643 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRIM2P49643 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRIM2P49643 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRIM2P49643 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRIM2P49643 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRIM2P49643 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRIM2P49643 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRIM2P49643 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRIM2P49643 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRIM2P49643 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRIM2P49643 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRIM2P49643 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRIM2P49643 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRIM2P49643 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRIM2P49643 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRIM2P49643 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIM2P49643 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIM2P49643 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIM2P49643 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIM2P49643 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIM2P49643 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIM2P49643 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIM2P49643 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIM2P49643 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIM2P49643 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIM2P49643 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRIM2P49643 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRIM2P49643 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRIM2P49643 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRIM2P49643 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRIM2P49643 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRIM2P49643 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRIM2P49643 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIM2P49643 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIM2P49643 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIM2P49643 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIM2P49643 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIM2P49643 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIM2P49643 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIM2P49643 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRIM2P49643 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIM2P49643 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIM2P49643 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIM2P49643 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms