Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT6CP48668 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT6CP48668 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT6CP48668 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT6CP48668 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT6CP48668 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT6CP48668 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT6CP48668 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT6CP48668 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT6CP48668 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT6CP48668 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT6CP48668 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT6CP48668 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT6CP48668 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT6CP48668 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT6CP48668 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT6CP48668 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT6CP48668 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT6CP48668 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT6CP48668 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT6CP48668 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT6CP48668 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT6CP48668 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT6CP48668 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT6CP48668 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT6CP48668 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT6CP48668 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT6CP48668 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT6CP48668 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT6CP48668 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT6CP48668 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT6CP48668 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT6CP48668 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT6CP48668 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT6CP48668 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT6CP48668 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT6CP48668 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT6CP48668 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT6CP48668 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT6CP48668 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT6CP48668 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT6CP48668 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT6CP48668 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT6CP48668 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT6CP48668 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT6CP48668 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT6CP48668 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT6CP48668 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT6CP48668 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT6CP48668 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT6CP48668 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT6CP48668 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT6CP48668 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT6CP48668 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT6CP48668 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT6CP48668 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT6CP48668 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT6CP48668 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT6CP48668 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT6CP48668 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT6CP48668 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT6CP48668 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT6CP48668 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT6CP48668 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT6CP48668 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT6CP48668 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT6CP48668 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT6CP48668 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT6CP48668 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT6CP48668 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT6CP48668 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT6CP48668 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT6CP48668 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT6CP48668 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT6CP48668 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT6CP48668 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT6CP48668 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT6CP48668 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT6CP48668 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT6CP48668 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT6CP48668 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT6CP48668 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT6CP48668 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT6CP48668 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT6CP48668 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT6CP48668 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT6CP48668 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT6CP48668 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT6CP48668 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT6CP48668 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT6CP48668 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT6CP48668 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT6CP48668 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT6CP48668 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT6CP48668 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT6CP48668 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT6CP48668 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT6CP48668 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT6CP48668 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT6CP48668 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms