Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSMD8P48556 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMD8P48556 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMD8P48556 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMD8P48556 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMD8P48556 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMD8P48556 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMD8P48556 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMD8P48556 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMD8P48556 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSMD8P48556 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSMD8P48556 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSMD8P48556 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMD8P48556 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMD8P48556 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMD8P48556 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMD8P48556 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMD8P48556 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMD8P48556 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMD8P48556 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMD8P48556 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMD8P48556 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMD8P48556 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMD8P48556 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMD8P48556 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMD8P48556 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMD8P48556 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMD8P48556 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMD8P48556 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMD8P48556 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMD8P48556 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMD8P48556 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMD8P48556 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMD8P48556 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMD8P48556 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMD8P48556 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMD8P48556 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMD8P48556 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMD8P48556 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMD8P48556 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMD8P48556 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMD8P48556 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMD8P48556 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMD8P48556 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMD8P48556 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMD8P48556 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMD8P48556 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMD8P48556 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSMD8P48556 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSMD8P48556 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSMD8P48556 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PSMD8P48556 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMD8P48556 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMD8P48556 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMD8P48556 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMD8P48556 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMD8P48556 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMD8P48556 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMD8P48556 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMD8P48556 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMD8P48556 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMD8P48556 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMD8P48556 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSMD8P48556 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSMD8P48556 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSMD8P48556 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSMD8P48556 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSMD8P48556 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMD8P48556 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMD8P48556 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMD8P48556 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSMD8P48556 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSMD8P48556 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSMD8P48556 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMD8P48556 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMD8P48556 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMD8P48556 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMD8P48556 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMD8P48556 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMD8P48556 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMD8P48556 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMD8P48556 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMD8P48556 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMD8P48556 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMD8P48556 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMD8P48556 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMD8P48556 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMD8P48556 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMD8P48556 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMD8P48556 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMD8P48556 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMD8P48556 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMD8P48556 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMD8P48556 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMD8P48556 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMD8P48556 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMD8P48556 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PSMD8P48556 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSMD8P48556 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMD8P48556 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms