Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GABRA4P48169 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GABRA4P48169 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GABRA4P48169 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GABRA4P48169 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GABRA4P48169 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABRA4P48169 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABRA4P48169 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABRA4P48169 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABRA4P48169 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABRA4P48169 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABRA4P48169 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABRA4P48169 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABRA4P48169 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABRA4P48169 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABRA4P48169 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABRA4P48169 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABRA4P48169 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABRA4P48169 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABRA4P48169 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABRA4P48169 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABRA4P48169 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABRA4P48169 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABRA4P48169 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABRA4P48169 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABRA4P48169 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABRA4P48169 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABRA4P48169 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABRA4P48169 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABRA4P48169 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABRA4P48169 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABRA4P48169 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABRA4P48169 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABRA4P48169 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRA4P48169 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRA4P48169 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRA4P48169 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRA4P48169 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRA4P48169 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRA4P48169 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRA4P48169 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRA4P48169 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRA4P48169 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRA4P48169 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRA4P48169 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRA4P48169 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRA4P48169 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRA4P48169 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRA4P48169 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRA4P48169 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABRA4P48169 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABRA4P48169 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRA4P48169 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRA4P48169 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRA4P48169 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRA4P48169 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GABRA4P48169 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABRA4P48169 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABRA4P48169 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRA4P48169 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRA4P48169 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRA4P48169 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRA4P48169 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRA4P48169 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRA4P48169 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRA4P48169 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRA4P48169 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRA4P48169 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRA4P48169 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRA4P48169 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRA4P48169 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GABRA4P48169 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GABRA4P48169 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GABRA4P48169 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GABRA4P48169 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABRA4P48169 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABRA4P48169 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRA4P48169 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRA4P48169 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRA4P48169 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABRA4P48169 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABRA4P48169 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABRA4P48169 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABRA4P48169 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABRA4P48169 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABRA4P48169 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABRA4P48169 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABRA4P48169 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABRA4P48169 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABRA4P48169 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABRA4P48169 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABRA4P48169 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABRA4P48169 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABRA4P48169 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABRA4P48169 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABRA4P48169 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABRA4P48169 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABRA4P48169 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABRA4P48169 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GABRA4P48169 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms