Protein–RNA interactions for Protein: P46019

PHKA2, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, liver isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA2P46019 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PHKA2P46019 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PHKA2P46019 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PHKA2P46019 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PHKA2P46019 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PHKA2P46019 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PHKA2P46019 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PHKA2P46019 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHKA2P46019 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHKA2P46019 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PHKA2P46019 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PHKA2P46019 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PHKA2P46019 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PHKA2P46019 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHKA2P46019 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHKA2P46019 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHKA2P46019 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PHKA2P46019 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHKA2P46019 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PHKA2P46019 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PHKA2P46019 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PHKA2P46019 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PHKA2P46019 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PHKA2P46019 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHKA2P46019 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHKA2P46019 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHKA2P46019 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHKA2P46019 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHKA2P46019 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHKA2P46019 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PHKA2P46019 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHKA2P46019 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHKA2P46019 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHKA2P46019 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHKA2P46019 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHKA2P46019 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHKA2P46019 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHKA2P46019 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHKA2P46019 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHKA2P46019 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHKA2P46019 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PHKA2P46019 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PHKA2P46019 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PHKA2P46019 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PHKA2P46019 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHKA2P46019 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHKA2P46019 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHKA2P46019 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHKA2P46019 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHKA2P46019 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHKA2P46019 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PHKA2P46019 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PHKA2P46019 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PHKA2P46019 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PHKA2P46019 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PHKA2P46019 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHKA2P46019 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHKA2P46019 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PHKA2P46019 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHKA2P46019 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHKA2P46019 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHKA2P46019 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHKA2P46019 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHKA2P46019 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PHKA2P46019 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PHKA2P46019 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PHKA2P46019 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PHKA2P46019 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHKA2P46019 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PHKA2P46019 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHKA2P46019 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHKA2P46019 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHKA2P46019 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PHKA2P46019 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHKA2P46019 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHKA2P46019 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHKA2P46019 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHKA2P46019 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHKA2P46019 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHKA2P46019 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PHKA2P46019 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PHKA2P46019 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PHKA2P46019 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHKA2P46019 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHKA2P46019 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHKA2P46019 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHKA2P46019 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PHKA2P46019 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PHKA2P46019 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHKA2P46019 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHKA2P46019 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHKA2P46019 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHKA2P46019 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHKA2P46019 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHKA2P46019 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHKA2P46019 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHKA2P46019 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHKA2P46019 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHKA2P46019 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHKA2P46019 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms