Protein–RNA interactions for Protein: P45985

MAP2K4, Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP2K4P45985 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP2K4P45985 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP2K4P45985 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP2K4P45985 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP2K4P45985 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP2K4P45985 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP2K4P45985 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP2K4P45985 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP2K4P45985 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP2K4P45985 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP2K4P45985 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP2K4P45985 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP2K4P45985 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP2K4P45985 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAP2K4P45985 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP2K4P45985 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAP2K4P45985 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAP2K4P45985 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAP2K4P45985 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAP2K4P45985 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP2K4P45985 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP2K4P45985 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP2K4P45985 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP2K4P45985 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP2K4P45985 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP2K4P45985 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP2K4P45985 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP2K4P45985 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MAP2K4P45985 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP2K4P45985 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP2K4P45985 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP2K4P45985 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP2K4P45985 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP2K4P45985 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP2K4P45985 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP2K4P45985 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP2K4P45985 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP2K4P45985 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP2K4P45985 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP2K4P45985 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP2K4P45985 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP2K4P45985 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP2K4P45985 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP2K4P45985 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP2K4P45985 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP2K4P45985 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MAP2K4P45985 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MAP2K4P45985 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MAP2K4P45985 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MAP2K4P45985 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MAP2K4P45985 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MAP2K4P45985 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MAP2K4P45985 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MAP2K4P45985 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MAP2K4P45985 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MAP2K4P45985 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MAP2K4P45985 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MAP2K4P45985 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MAP2K4P45985 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MAP2K4P45985 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MAP2K4P45985 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MAP2K4P45985 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MAP2K4P45985 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MAP2K4P45985 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MAP2K4P45985 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MAP2K4P45985 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MAP2K4P45985 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAP2K4P45985 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAP2K4P45985 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAP2K4P45985 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAP2K4P45985 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAP2K4P45985 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAP2K4P45985 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAP2K4P45985 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MAP2K4P45985 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MAP2K4P45985 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MAP2K4P45985 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MAP2K4P45985 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MAP2K4P45985 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MAP2K4P45985 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAP2K4P45985 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAP2K4P45985 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAP2K4P45985 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MAP2K4P45985 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MAP2K4P45985 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MAP2K4P45985 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MAP2K4P45985 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAP2K4P45985 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAP2K4P45985 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAP2K4P45985 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAP2K4P45985 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAP2K4P45985 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAP2K4P45985 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAP2K4P45985 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAP2K4P45985 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP2K4P45985 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP2K4P45985 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP2K4P45985 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAP2K4P45985 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAP2K4P45985 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.1 ms