Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCG1P45844 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCG1P45844 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCG1P45844 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCG1P45844 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCG1P45844 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCG1P45844 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCG1P45844 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCG1P45844 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCG1P45844 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCG1P45844 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCG1P45844 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCG1P45844 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCG1P45844 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCG1P45844 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCG1P45844 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCG1P45844 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCG1P45844 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCG1P45844 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCG1P45844 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCG1P45844 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCG1P45844 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCG1P45844 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCG1P45844 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCG1P45844 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCG1P45844 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCG1P45844 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCG1P45844 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCG1P45844 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCG1P45844 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCG1P45844 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCG1P45844 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCG1P45844 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCG1P45844 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCG1P45844 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCG1P45844 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCG1P45844 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCG1P45844 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCG1P45844 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCG1P45844 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCG1P45844 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCG1P45844 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCG1P45844 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCG1P45844 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCG1P45844 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCG1P45844 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCG1P45844 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCG1P45844 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCG1P45844 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCG1P45844 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCG1P45844 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ABCG1P45844 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCG1P45844 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCG1P45844 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCG1P45844 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCG1P45844 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCG1P45844 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCG1P45844 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCG1P45844 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCG1P45844 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCG1P45844 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCG1P45844 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCG1P45844 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCG1P45844 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCG1P45844 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCG1P45844 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ABCG1P45844 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ABCG1P45844 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ABCG1P45844 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCG1P45844 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCG1P45844 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCG1P45844 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCG1P45844 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCG1P45844 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCG1P45844 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCG1P45844 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCG1P45844 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCG1P45844 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCG1P45844 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCG1P45844 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCG1P45844 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCG1P45844 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCG1P45844 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCG1P45844 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCG1P45844 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCG1P45844 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCG1P45844 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCG1P45844 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCG1P45844 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCG1P45844 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCG1P45844 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ABCG1P45844 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCG1P45844 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCG1P45844 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCG1P45844 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCG1P45844 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCG1P45844 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCG1P45844 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCG1P45844 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCG1P45844 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms