Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
MCAMP43121 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
MCAMP43121 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
MCAMP43121 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
MCAMP43121 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
MCAMP43121 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
MCAMP43121 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
MCAMP43121 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
MCAMP43121 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
MCAMP43121 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MCAMP43121 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MCAMP43121 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MCAMP43121 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
MCAMP43121 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
MCAMP43121 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
MCAMP43121 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
MCAMP43121 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
MCAMP43121 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
MCAMP43121 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
MCAMP43121 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
MCAMP43121 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
MCAMP43121 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
MCAMP43121 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
MCAMP43121 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
MCAMP43121 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
MCAMP43121 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
MCAMP43121 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
MCAMP43121 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
MCAMP43121 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
MCAMP43121 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
MCAMP43121 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
MCAMP43121 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
MCAMP43121 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MCAMP43121 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
MCAMP43121 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
MCAMP43121 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
MCAMP43121 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MCAMP43121 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MCAMP43121 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MCAMP43121 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
MCAMP43121 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
MCAMP43121 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
MCAMP43121 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
MCAMP43121 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
MCAMP43121 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
MCAMP43121 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
MCAMP43121 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
MCAMP43121 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
MCAMP43121 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MCAMP43121 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
MCAMP43121 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
MCAMP43121 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
MCAMP43121 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
MCAMP43121 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
MCAMP43121 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
MCAMP43121 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
MCAMP43121 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
MCAMP43121 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
MCAMP43121 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
MCAMP43121 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
MCAMP43121 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MCAMP43121 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MCAMP43121 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MCAMP43121 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MCAMP43121 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MCAMP43121 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MCAMP43121 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MCAMP43121 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MCAMP43121 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
MCAMP43121 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MCAMP43121 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
MCAMP43121 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
MCAMP43121 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
MCAMP43121 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MCAMP43121 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
MCAMP43121 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
MCAMP43121 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
MCAMP43121 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
MCAMP43121 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
MCAMP43121 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
MCAMP43121 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
MCAMP43121 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
MCAMP43121 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
MCAMP43121 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
MCAMP43121 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
MCAMP43121 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
MCAMP43121 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
MCAMP43121 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
MCAMP43121 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
MCAMP43121 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
MCAMP43121 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
MCAMP43121 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
MCAMP43121 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
MCAMP43121 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MCAMP43121 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MCAMP43121 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
MCAMP43121 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MCAMP43121 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MCAMP43121 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MCAMP43121 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms