Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGER3P43115 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGER3P43115 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGER3P43115 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTGER3P43115 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTGER3P43115 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTGER3P43115 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTGER3P43115 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTGER3P43115 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTGER3P43115 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTGER3P43115 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTGER3P43115 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTGER3P43115 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTGER3P43115 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTGER3P43115 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTGER3P43115 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTGER3P43115 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTGER3P43115 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTGER3P43115 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTGER3P43115 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTGER3P43115 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTGER3P43115 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTGER3P43115 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTGER3P43115 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTGER3P43115 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTGER3P43115 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTGER3P43115 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTGER3P43115 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTGER3P43115 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTGER3P43115 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTGER3P43115 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTGER3P43115 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTGER3P43115 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTGER3P43115 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTGER3P43115 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTGER3P43115 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTGER3P43115 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTGER3P43115 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTGER3P43115 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PTGER3P43115 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTGER3P43115 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTGER3P43115 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTGER3P43115 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTGER3P43115 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTGER3P43115 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTGER3P43115 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTGER3P43115 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTGER3P43115 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTGER3P43115 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTGER3P43115 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTGER3P43115 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTGER3P43115 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTGER3P43115 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTGER3P43115 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTGER3P43115 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTGER3P43115 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTGER3P43115 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PTGER3P43115 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTGER3P43115 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTGER3P43115 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTGER3P43115 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTGER3P43115 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTGER3P43115 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTGER3P43115 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTGER3P43115 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTGER3P43115 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTGER3P43115 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTGER3P43115 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTGER3P43115 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTGER3P43115 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTGER3P43115 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTGER3P43115 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTGER3P43115 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTGER3P43115 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTGER3P43115 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PTGER3P43115 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTGER3P43115 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTGER3P43115 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTGER3P43115 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PTGER3P43115 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTGER3P43115 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTGER3P43115 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTGER3P43115 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTGER3P43115 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTGER3P43115 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTGER3P43115 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTGER3P43115 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PTGER3P43115 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGER3P43115 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGER3P43115 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGER3P43115 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGER3P43115 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTGER3P43115 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTGER3P43115 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTGER3P43115 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTGER3P43115 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTGER3P43115 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTGER3P43115 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTGER3P43115 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTGER3P43115 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms