Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASP2P42575 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASP2P42575 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP2P42575 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP2P42575 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP2P42575 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP2P42575 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP2P42575 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP2P42575 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASP2P42575 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASP2P42575 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASP2P42575 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CASP2P42575 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP2P42575 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP2P42575 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP2P42575 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP2P42575 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP2P42575 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP2P42575 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP2P42575 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP2P42575 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP2P42575 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP2P42575 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP2P42575 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP2P42575 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP2P42575 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP2P42575 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP2P42575 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP2P42575 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP2P42575 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP2P42575 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP2P42575 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP2P42575 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP2P42575 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP2P42575 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP2P42575 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP2P42575 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP2P42575 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP2P42575 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP2P42575 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP2P42575 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP2P42575 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP2P42575 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP2P42575 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP2P42575 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP2P42575 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP2P42575 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP2P42575 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP2P42575 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP2P42575 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP2P42575 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP2P42575 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP2P42575 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP2P42575 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP2P42575 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP2P42575 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP2P42575 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP2P42575 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP2P42575 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP2P42575 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP2P42575 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP2P42575 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP2P42575 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP2P42575 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP2P42575 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP2P42575 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP2P42575 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP2P42575 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP2P42575 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP2P42575 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP2P42575 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP2P42575 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP2P42575 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP2P42575 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP2P42575 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP2P42575 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP2P42575 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP2P42575 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP2P42575 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP2P42575 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP2P42575 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP2P42575 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP2P42575 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP2P42575 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP2P42575 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP2P42575 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CASP2P42575 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP2P42575 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP2P42575 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP2P42575 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP2P42575 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP2P42575 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP2P42575 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP2P42575 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP2P42575 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP2P42575 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP2P42575 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP2P42575 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP2P42575 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP2P42575 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms