Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMP12P39900 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP12P39900 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP12P39900 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP12P39900 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP12P39900 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP12P39900 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP12P39900 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP12P39900 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP12P39900 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP12P39900 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP12P39900 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP12P39900 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MMP12P39900 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MMP12P39900 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MMP12P39900 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMP12P39900 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMP12P39900 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP12P39900 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP12P39900 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP12P39900 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP12P39900 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP12P39900 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP12P39900 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP12P39900 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP12P39900 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP12P39900 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP12P39900 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP12P39900 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP12P39900 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP12P39900 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP12P39900 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP12P39900 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP12P39900 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP12P39900 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MMP12P39900 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MMP12P39900 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MMP12P39900 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MMP12P39900 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MMP12P39900 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MMP12P39900 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MMP12P39900 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MMP12P39900 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MMP12P39900 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MMP12P39900 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MMP12P39900 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MMP12P39900 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MMP12P39900 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MMP12P39900 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MMP12P39900 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MMP12P39900 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MMP12P39900 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MMP12P39900 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MMP12P39900 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MMP12P39900 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MMP12P39900 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MMP12P39900 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MMP12P39900 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MMP12P39900 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MMP12P39900 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MMP12P39900 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MMP12P39900 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MMP12P39900 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MMP12P39900 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MMP12P39900 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MMP12P39900 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP12P39900 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP12P39900 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP12P39900 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP12P39900 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP12P39900 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP12P39900 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP12P39900 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP12P39900 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP12P39900 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP12P39900 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP12P39900 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP12P39900 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MMP12P39900 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MMP12P39900 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP12P39900 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MMP12P39900 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMP12P39900 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMP12P39900 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP12P39900 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP12P39900 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP12P39900 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP12P39900 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP12P39900 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP12P39900 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP12P39900 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP12P39900 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP12P39900 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP12P39900 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP12P39900 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP12P39900 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP12P39900 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP12P39900 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP12P39900 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MMP12P39900 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms