Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACVR1BP36896 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ACVR1BP36896 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACVR1BP36896 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACVR1BP36896 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACVR1BP36896 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACVR1BP36896 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACVR1BP36896 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ACVR1BP36896 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACVR1BP36896 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACVR1BP36896 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACVR1BP36896 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACVR1BP36896 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACVR1BP36896 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACVR1BP36896 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACVR1BP36896 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACVR1BP36896 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ACVR1BP36896 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ACVR1BP36896 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACVR1BP36896 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACVR1BP36896 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACVR1BP36896 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACVR1BP36896 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACVR1BP36896 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ACVR1BP36896 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACVR1BP36896 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACVR1BP36896 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACVR1BP36896 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACVR1BP36896 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACVR1BP36896 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACVR1BP36896 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACVR1BP36896 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACVR1BP36896 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACVR1BP36896 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACVR1BP36896 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACVR1BP36896 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACVR1BP36896 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACVR1BP36896 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACVR1BP36896 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACVR1BP36896 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACVR1BP36896 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ACVR1BP36896 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACVR1BP36896 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACVR1BP36896 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACVR1BP36896 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACVR1BP36896 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACVR1BP36896 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACVR1BP36896 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACVR1BP36896 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACVR1BP36896 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACVR1BP36896 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACVR1BP36896 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACVR1BP36896 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACVR1BP36896 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACVR1BP36896 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACVR1BP36896 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACVR1BP36896 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACVR1BP36896 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACVR1BP36896 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACVR1BP36896 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACVR1BP36896 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACVR1BP36896 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACVR1BP36896 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACVR1BP36896 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACVR1BP36896 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACVR1BP36896 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACVR1BP36896 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACVR1BP36896 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ACVR1BP36896 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACVR1BP36896 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACVR1BP36896 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACVR1BP36896 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACVR1BP36896 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACVR1BP36896 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACVR1BP36896 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACVR1BP36896 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACVR1BP36896 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACVR1BP36896 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACVR1BP36896 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACVR1BP36896 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACVR1BP36896 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACVR1BP36896 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACVR1BP36896 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACVR1BP36896 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ACVR1BP36896 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACVR1BP36896 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ACVR1BP36896 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACVR1BP36896 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACVR1BP36896 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACVR1BP36896 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACVR1BP36896 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACVR1BP36896 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACVR1BP36896 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACVR1BP36896 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACVR1BP36896 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACVR1BP36896 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACVR1BP36896 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACVR1BP36896 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACVR1BP36896 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACVR1BP36896 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms