Protein–RNA interactions for Protein: P32314

FOXN2, Forkhead box protein N2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN2P32314 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXN2P32314 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXN2P32314 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXN2P32314 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXN2P32314 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXN2P32314 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXN2P32314 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXN2P32314 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXN2P32314 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXN2P32314 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXN2P32314 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXN2P32314 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXN2P32314 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXN2P32314 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXN2P32314 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXN2P32314 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXN2P32314 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FOXN2P32314 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXN2P32314 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXN2P32314 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXN2P32314 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXN2P32314 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXN2P32314 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXN2P32314 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXN2P32314 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXN2P32314 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXN2P32314 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXN2P32314 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXN2P32314 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXN2P32314 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXN2P32314 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOXN2P32314 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FOXN2P32314 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FOXN2P32314 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXN2P32314 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXN2P32314 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXN2P32314 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXN2P32314 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXN2P32314 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXN2P32314 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXN2P32314 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXN2P32314 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXN2P32314 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXN2P32314 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXN2P32314 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXN2P32314 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXN2P32314 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXN2P32314 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXN2P32314 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXN2P32314 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXN2P32314 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXN2P32314 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXN2P32314 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXN2P32314 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXN2P32314 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXN2P32314 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXN2P32314 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXN2P32314 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXN2P32314 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXN2P32314 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXN2P32314 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXN2P32314 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXN2P32314 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXN2P32314 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXN2P32314 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXN2P32314 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXN2P32314 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXN2P32314 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXN2P32314 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXN2P32314 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXN2P32314 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXN2P32314 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXN2P32314 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXN2P32314 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXN2P32314 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXN2P32314 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXN2P32314 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXN2P32314 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXN2P32314 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXN2P32314 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXN2P32314 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXN2P32314 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXN2P32314 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXN2P32314 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXN2P32314 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXN2P32314 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXN2P32314 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXN2P32314 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXN2P32314 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXN2P32314 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXN2P32314 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXN2P32314 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXN2P32314 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FOXN2P32314 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXN2P32314 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXN2P32314 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXN2P32314 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXN2P32314 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXN2P32314 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXN2P32314 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms