Protein–RNA interactions for Protein: P31483

TIA1, Nucleolysin TIA-1 isoform p40, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIA1P31483 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.017e-14■■■■■ 44.4
TIA1P31483 EPHB4-206ENST00000487222 5058 ntTSL 1 (best)14.17□□□□□ -0.147e-14■■■■■ 44.4
TIA1P31483 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.237e-14■■■■■ 44.4
TIA1P31483 EPHB4-202ENST00000360620 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.577e-14■■■■■ 44.4
TIA1P31483 RPSA-203ENST00000444512 701 ntTSL 217.98■□□□□ 0.472e-9■■■■■ 44.4
TIA1P31483 RPSA-208ENST00000487876 572 ntTSL 411.92□□□□□ -0.52e-9■■■■■ 44.4
TIA1P31483 RPSA-204ENST00000458478 874 ntTSL 210.2□□□□□ -0.782e-9■■■■■ 44.4
TIA1P31483 RPSA-201ENST00000301821 1171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.942e-9■■■■■ 44.4
TIA1P31483 RPSA-206ENST00000477325 596 ntTSL 28.34□□□□□ -1.072e-9■■■■■ 44.4
TIA1P31483 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.32e-9■■■■■ 44.4
TIA1P31483 RPSA-205ENST00000475346 622 ntTSL 1 (best)5.07□□□□□ -1.62e-9■■■■■ 44.4
TIA1P31483 SRSF5-208ENST00000554929 947 ntTSL 29.79□□□□□ -0.843e-20■■■■■ 44.4
TIA1P31483 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.387e-12■■■■■ 44.4
TIA1P31483 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 44.4
TIA1P31483 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 44.4
TIA1P31483 SF3B1-208ENST00000470268 2003 ntTSL 24.45□□□□□ -1.71e-23■■■■■ 44.3
TIA1P31483 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.453e-12■■■■■ 43.8
TIA1P31483 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.82e-7■■■■■ 43.7
TIA1P31483 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.532e-12■■■■■ 43.7
TIA1P31483 MT1G-204ENST00000569500 305 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.622e-12■■■■■ 43.7
TIA1P31483 MT1G-201ENST00000379811 405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.822e-12■■■■■ 43.7
TIA1P31483 MT1G-202ENST00000444837 406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.142e-12■■■■■ 43.7
TIA1P31483 PAPSS1-208ENST00000514815 296 ntTSL 512.19□□□□□ -0.465e-12■■■■■ 43.7
TIA1P31483 PAPSS1-201ENST00000265174 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.635e-12■■■■■ 43.7
TIA1P31483 SELENOP-214ENST00000514985 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.74e-8■■■■■ 43.7
TIA1P31483 SELENOP-209ENST00000511224 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.094e-8■■■■■ 43.7
TIA1P31483 SELENOP-210ENST00000512980 4175 ntTSL 26.59□□□□□ -1.354e-8■■■■■ 43.7
TIA1P31483 FGL1-204ENST00000398056 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.711e-6■■■■■ 43.5
TIA1P31483 A2M-209ENST00000539638 590 ntTSL 44.66□□□□□ -1.667e-7■■■■■ 43.3
TIA1P31483 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.087e-22■■■■■ 43.3
TIA1P31483 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.277e-22■■■■■ 43.3
TIA1P31483 LASP1-203ENST00000433206 4023 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.723e-15■■■■■ 43.3
TIA1P31483 LASP1-204ENST00000435347 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.723e-15■■■■■ 43.3
TIA1P31483 LASP1-201ENST00000318008 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.783e-15■■■■■ 43.3
TIA1P31483 SELENOP-215ENST00000515626 566 ntTSL 49.36□□□□□ -0.913e-15■■■■■ 43.3
TIA1P31483 SELENOP-202ENST00000506078 799 ntTSL 27.89□□□□□ -1.153e-15■■■■■ 43.3
TIA1P31483 COX6A1-202ENST00000549525 767 nt6.13□□□□□ -1.437e-22■■■■■ 43.3
TIA1P31483 SELENOP-207ENST00000510650 580 ntTSL 33.61□□□□□ -1.833e-15■■■■■ 43.3
TIA1P31483 ZFR-201ENST00000265069 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 43
TIA1P31483 ZFR-202ENST00000502988 2184 ntTSL 1 (best)4.67□□□□□ -1.662e-7■■■■■ 43
TIA1P31483 ZFR-207ENST00000514356 3109 ntTSL 23.73□□□□□ -1.812e-7■■■■■ 43
TIA1P31483 ZFR-206ENST00000510369 1551 ntTSL 1 (best)3.48□□□□□ -1.852e-7■■■■■ 43
TIA1P31483 BHLHE40-201ENST00000256495 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.482e-8■■■■■ 43
TIA1P31483 PRKAR1A-214ENST00000588188 1209 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.083e-7■■■■■ 42.9
TIA1P31483 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.552e-11■■■■■ 42.9
TIA1P31483 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.432e-11■■■■■ 42.9
TIA1P31483 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.112e-11■■■■■ 42.9
TIA1P31483 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.382e-11■■■■■ 42.9
TIA1P31483 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.42e-11■■■■■ 42.9
TIA1P31483 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.422e-11■■■■■ 42.9
TIA1P31483 SLC25A3-214ENST00000551123 1417 ntTSL 1 (best)11.72□□□□□ -0.532e-11■■■■■ 42.9
TIA1P31483 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.62e-11■■■■■ 42.9
TIA1P31483 SLC25A3-203ENST00000401722 6087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.662e-11■■■■■ 42.9
TIA1P31483 SLC25A3-204ENST00000546766 3236 ntTSL 1 (best)9.94□□□□□ -0.822e-11■■■■■ 42.9
TIA1P31483 SLC25A3-205ENST00000547444 517 ntTSL 1 (best)7.82□□□□□ -1.162e-11■■■■■ 42.9
TIA1P31483 SLC25A3-208ENST00000547908 893 ntTSL 26.02□□□□□ -1.452e-11■■■■■ 42.9
TIA1P31483 TSNAX-DISC1-203ENST00000602885 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.07□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 42.9
TIA1P31483 TSNAX-DISC1-204ENST00000602956 3294 ntAPPRIS P5 TSL 210.83□□□□□ -0.683e-6■■■■■ 42.9
TIA1P31483 TSNAX-DISC1-202ENST00000602634 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 210.47□□□□□ -0.733e-6■■■■■ 42.9
TIA1P31483 TSNAX-DISC1-205ENST00000602962 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 42.9
TIA1P31483 TSNAX-DISC1-201ENST00000602567 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 29.41□□□□□ -0.93e-6■■■■■ 42.9
TIA1P31483 TSNAX-201ENST00000366639 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.983e-6■■■■■ 42.9
TIA1P31483 TSNAX-203ENST00000475168 5629 ntTSL 26.58□□□□□ -1.363e-6■■■■■ 42.9
TIA1P31483 HNRNPH1-231ENST00000519033 832 ntTSL 315.9■□□□□ 0.144e-10■■■■■ 42.9
TIA1P31483 HNRNPH1-248ENST00000524179 598 ntTSL 213.94□□□□□ -0.184e-10■■■■■ 42.9
TIA1P31483 HNRNPH1-246ENST00000523449 793 ntTSL 311.72□□□□□ -0.534e-10■■■■■ 42.9
TIA1P31483 DAZAP1-204ENST00000586579 619 ntTSL 321■□□□□ 0.951e-11■■■■■ 42.8
TIA1P31483 DAZAP1-210ENST00000592453 1021 ntTSL 514.37□□□□□ -0.111e-11■■■■■ 42.8
TIA1P31483 COTL1-202ENST00000561707 781 ntTSL 1 (best)12.21□□□□□ -0.452e-10■■■■■ 42.8
TIA1P31483 GANAB-216ENST00000540933 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.697e-46■■■■■ 42.7
TIA1P31483 GANAB-201ENST00000346178 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.837e-46■■■■■ 42.7
TIA1P31483 GANAB-211ENST00000532402 3718 ntTSL 1 (best)9.06□□□□□ -0.967e-46■■■■■ 42.7
TIA1P31483 KHDRBS1-203ENST00000484270 1989 ntTSL 518.68■□□□□ 0.583e-15■■■■■ 42.7
TIA1P31483 KHDRBS1-201ENST00000307714 2738 ntTSL 1 (best)18.11■□□□□ 0.493e-15■■■■■ 42.7
TIA1P31483 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.083e-15■■■■■ 42.7
TIA1P31483 HIF1A-203ENST00000394997 3922 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.843e-7■■■■■ 42.6
TIA1P31483 HIF1A-202ENST00000337138 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.873e-7■■■■■ 42.6
TIA1P31483 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.643e-7■■■■■ 42.6
TIA1P31483 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.023e-7■■■■■ 42.6
TIA1P31483 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.233e-7■■■■■ 42.6
TIA1P31483 GNPAT-203ENST00000436239 839 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.63■□□□□ 0.251e-9■■■■■ 42.4
TIA1P31483 GNPAT-202ENST00000416000 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.56■□□□□ 0.081e-9■■■■■ 42.4
TIA1P31483 GNPAT-201ENST00000366647 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.251e-9■■■■■ 42.4
TIA1P31483 RANBP1-210ENST00000435265 1879 ntTSL 218.69■□□□□ 0.586e-9■■■■■ 42.4
TIA1P31483 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.246e-9■■■■■ 42.4
TIA1P31483 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.134e-15■■■■■ 42.4
TIA1P31483 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.114e-15■■■■■ 42.4
TIA1P31483 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.074e-15■■■■■ 42.4
TIA1P31483 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.074e-15■■■■■ 42.4
TIA1P31483 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.024e-15■■■■■ 42.4
TIA1P31483 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.024e-15■■■■■ 42.4
TIA1P31483 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.144e-15■■■■■ 42.4
TIA1P31483 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.184e-15■■■■■ 42.4
TIA1P31483 TPD52L2-208ENST00000474176 4053 ntTSL 29.93□□□□□ -0.824e-15■■■■■ 42.4
TIA1P31483 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.053e-9■■■■■ 42.3
TIA1P31483 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.123e-9■■■■■ 42.3
TIA1P31483 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.443e-9■■■■■ 42.3
TIA1P31483 ARGLU1-204ENST00000472226 1336 ntTSL 26□□□□□ -1.459e-13■■■■■ 42.3
TIA1P31483 TXLNGY-206ENST00000459719 2098 ntTSL 214.96□□□□□ -0.028e-14■■■■■ 42.2
TIA1P31483 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.448e-14■■■■■ 42.2
Retrieved 100 of 17,249 protein–RNA pairs in 317.1 ms