Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
HOXA13P31271 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HOXA13P31271 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
HOXA13P31271 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HOXA13P31271 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
HOXA13P31271 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HOXA13P31271 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HOXA13P31271 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HOXA13P31271 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
HOXA13P31271 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HOXA13P31271 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HOXA13P31271 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HOXA13P31271 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HOXA13P31271 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HOXA13P31271 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HOXA13P31271 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HOXA13P31271 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HOXA13P31271 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HOXA13P31271 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HOXA13P31271 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HOXA13P31271 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HOXA13P31271 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HOXA13P31271 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HOXA13P31271 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
HOXA13P31271 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HOXA13P31271 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
HOXA13P31271 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
HOXA13P31271 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HOXA13P31271 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HOXA13P31271 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HOXA13P31271 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HOXA13P31271 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HOXA13P31271 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HOXA13P31271 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HOXA13P31271 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HOXA13P31271 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HOXA13P31271 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HOXA13P31271 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HOXA13P31271 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HOXA13P31271 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HOXA13P31271 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HOXA13P31271 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HOXA13P31271 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
HOXA13P31271 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HOXA13P31271 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
HOXA13P31271 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HOXA13P31271 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HOXA13P31271 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HOXA13P31271 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HOXA13P31271 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HOXA13P31271 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HOXA13P31271 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
HOXA13P31271 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HOXA13P31271 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HOXA13P31271 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
HOXA13P31271 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HOXA13P31271 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
HOXA13P31271 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HOXA13P31271 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
HOXA13P31271 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HOXA13P31271 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HOXA13P31271 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HOXA13P31271 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HOXA13P31271 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HOXA13P31271 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HOXA13P31271 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HOXA13P31271 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HOXA13P31271 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HOXA13P31271 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HOXA13P31271 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HOXA13P31271 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HOXA13P31271 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
HOXA13P31271 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
HOXA13P31271 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
HOXA13P31271 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HOXA13P31271 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HOXA13P31271 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HOXA13P31271 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HOXA13P31271 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HOXA13P31271 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HOXA13P31271 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HOXA13P31271 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HOXA13P31271 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HOXA13P31271 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
HOXA13P31271 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HOXA13P31271 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HOXA13P31271 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HOXA13P31271 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HOXA13P31271 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HOXA13P31271 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HOXA13P31271 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HOXA13P31271 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HOXA13P31271 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HOXA13P31271 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HOXA13P31271 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HOXA13P31271 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HOXA13P31271 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
HOXA13P31271 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
HOXA13P31271 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
HOXA13P31271 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms