Protein–RNA interactions for Protein: P30154

PPP2R1B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R1BP30154 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP2R1BP30154 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP2R1BP30154 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP2R1BP30154 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP2R1BP30154 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP2R1BP30154 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP2R1BP30154 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP2R1BP30154 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP2R1BP30154 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP2R1BP30154 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP2R1BP30154 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP2R1BP30154 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP2R1BP30154 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP2R1BP30154 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP2R1BP30154 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP2R1BP30154 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP2R1BP30154 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP2R1BP30154 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP2R1BP30154 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP2R1BP30154 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP2R1BP30154 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP2R1BP30154 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP2R1BP30154 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP2R1BP30154 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP2R1BP30154 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP2R1BP30154 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP2R1BP30154 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP2R1BP30154 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP2R1BP30154 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP2R1BP30154 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP2R1BP30154 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PPP2R1BP30154 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPP2R1BP30154 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PPP2R1BP30154 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPP2R1BP30154 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPP2R1BP30154 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPP2R1BP30154 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PPP2R1BP30154 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP2R1BP30154 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP2R1BP30154 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP2R1BP30154 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP2R1BP30154 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP2R1BP30154 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP2R1BP30154 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP2R1BP30154 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP2R1BP30154 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP2R1BP30154 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP2R1BP30154 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP2R1BP30154 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP2R1BP30154 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP2R1BP30154 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP2R1BP30154 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP2R1BP30154 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP2R1BP30154 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP2R1BP30154 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPP2R1BP30154 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP2R1BP30154 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP2R1BP30154 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP2R1BP30154 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP2R1BP30154 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP2R1BP30154 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP2R1BP30154 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP2R1BP30154 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP2R1BP30154 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP2R1BP30154 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP2R1BP30154 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP2R1BP30154 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP2R1BP30154 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP2R1BP30154 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP2R1BP30154 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP2R1BP30154 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP2R1BP30154 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP2R1BP30154 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP2R1BP30154 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP2R1BP30154 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP2R1BP30154 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP2R1BP30154 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP2R1BP30154 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP2R1BP30154 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP2R1BP30154 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP2R1BP30154 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPP2R1BP30154 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PPP2R1BP30154 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PPP2R1BP30154 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPP2R1BP30154 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP2R1BP30154 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP2R1BP30154 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP2R1BP30154 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP2R1BP30154 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP2R1BP30154 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP2R1BP30154 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP2R1BP30154 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP2R1BP30154 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP2R1BP30154 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP2R1BP30154 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP2R1BP30154 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP2R1BP30154 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP2R1BP30154 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP2R1BP30154 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PPP2R1BP30154 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms