Protein–RNA interactions for Protein: P28799

GRN, Granulins, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRNP28799 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GRNP28799 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GRNP28799 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRNP28799 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRNP28799 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRNP28799 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRNP28799 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRNP28799 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRNP28799 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GRNP28799 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GRNP28799 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GRNP28799 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRNP28799 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRNP28799 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GRNP28799 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRNP28799 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRNP28799 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRNP28799 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRNP28799 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRNP28799 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRNP28799 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRNP28799 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GRNP28799 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRNP28799 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRNP28799 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRNP28799 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRNP28799 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRNP28799 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRNP28799 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRNP28799 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRNP28799 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRNP28799 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRNP28799 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRNP28799 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRNP28799 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GRNP28799 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRNP28799 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRNP28799 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRNP28799 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRNP28799 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRNP28799 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRNP28799 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRNP28799 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRNP28799 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRNP28799 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRNP28799 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRNP28799 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRNP28799 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRNP28799 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRNP28799 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRNP28799 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRNP28799 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRNP28799 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRNP28799 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRNP28799 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRNP28799 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRNP28799 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRNP28799 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRNP28799 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRNP28799 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRNP28799 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRNP28799 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRNP28799 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRNP28799 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRNP28799 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRNP28799 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRNP28799 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRNP28799 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRNP28799 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRNP28799 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRNP28799 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRNP28799 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRNP28799 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRNP28799 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRNP28799 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRNP28799 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRNP28799 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRNP28799 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRNP28799 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRNP28799 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRNP28799 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRNP28799 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRNP28799 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRNP28799 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRNP28799 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRNP28799 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRNP28799 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRNP28799 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRNP28799 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRNP28799 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRNP28799 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRNP28799 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRNP28799 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRNP28799 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRNP28799 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRNP28799 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRNP28799 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRNP28799 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRNP28799 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRNP28799 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms