Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTR1EP28566 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTR1EP28566 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTR1EP28566 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTR1EP28566 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTR1EP28566 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HTR1EP28566 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTR1EP28566 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HTR1EP28566 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTR1EP28566 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTR1EP28566 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTR1EP28566 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTR1EP28566 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTR1EP28566 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTR1EP28566 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTR1EP28566 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTR1EP28566 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HTR1EP28566 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTR1EP28566 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTR1EP28566 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTR1EP28566 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTR1EP28566 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTR1EP28566 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTR1EP28566 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTR1EP28566 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTR1EP28566 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTR1EP28566 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTR1EP28566 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTR1EP28566 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTR1EP28566 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTR1EP28566 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTR1EP28566 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HTR1EP28566 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTR1EP28566 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTR1EP28566 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTR1EP28566 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTR1EP28566 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTR1EP28566 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTR1EP28566 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTR1EP28566 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTR1EP28566 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTR1EP28566 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTR1EP28566 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTR1EP28566 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTR1EP28566 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTR1EP28566 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTR1EP28566 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTR1EP28566 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTR1EP28566 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTR1EP28566 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTR1EP28566 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTR1EP28566 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTR1EP28566 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTR1EP28566 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTR1EP28566 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTR1EP28566 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTR1EP28566 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTR1EP28566 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTR1EP28566 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTR1EP28566 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTR1EP28566 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTR1EP28566 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTR1EP28566 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTR1EP28566 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTR1EP28566 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTR1EP28566 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HTR1EP28566 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTR1EP28566 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTR1EP28566 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTR1EP28566 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTR1EP28566 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HTR1EP28566 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTR1EP28566 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTR1EP28566 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTR1EP28566 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTR1EP28566 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTR1EP28566 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTR1EP28566 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HTR1EP28566 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HTR1EP28566 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HTR1EP28566 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HTR1EP28566 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTR1EP28566 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTR1EP28566 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTR1EP28566 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTR1EP28566 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTR1EP28566 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTR1EP28566 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTR1EP28566 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTR1EP28566 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HTR1EP28566 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTR1EP28566 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTR1EP28566 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTR1EP28566 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTR1EP28566 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTR1EP28566 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTR1EP28566 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTR1EP28566 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTR1EP28566 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTR1EP28566 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms