Protein–RNA interactions for Protein: P25440

BRD2, Bromodomain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD2P25440 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRD2P25440 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRD2P25440 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRD2P25440 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRD2P25440 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRD2P25440 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRD2P25440 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRD2P25440 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRD2P25440 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRD2P25440 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRD2P25440 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRD2P25440 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRD2P25440 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRD2P25440 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRD2P25440 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRD2P25440 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BRD2P25440 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BRD2P25440 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BRD2P25440 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRD2P25440 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRD2P25440 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRD2P25440 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRD2P25440 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRD2P25440 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRD2P25440 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRD2P25440 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BRD2P25440 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BRD2P25440 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRD2P25440 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRD2P25440 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRD2P25440 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRD2P25440 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRD2P25440 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRD2P25440 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRD2P25440 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRD2P25440 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRD2P25440 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
BRD2P25440 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRD2P25440 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRD2P25440 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRD2P25440 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRD2P25440 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRD2P25440 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRD2P25440 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRD2P25440 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
BRD2P25440 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRD2P25440 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRD2P25440 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRD2P25440 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRD2P25440 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRD2P25440 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRD2P25440 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
BRD2P25440 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRD2P25440 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRD2P25440 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
BRD2P25440 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRD2P25440 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRD2P25440 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRD2P25440 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRD2P25440 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
BRD2P25440 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRD2P25440 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
BRD2P25440 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRD2P25440 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRD2P25440 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRD2P25440 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRD2P25440 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRD2P25440 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRD2P25440 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRD2P25440 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRD2P25440 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRD2P25440 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRD2P25440 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRD2P25440 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRD2P25440 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRD2P25440 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRD2P25440 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRD2P25440 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRD2P25440 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BRD2P25440 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRD2P25440 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRD2P25440 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRD2P25440 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRD2P25440 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
BRD2P25440 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRD2P25440 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRD2P25440 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRD2P25440 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRD2P25440 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRD2P25440 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD2P25440 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD2P25440 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD2P25440 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD2P25440 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD2P25440 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRD2P25440 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BRD2P25440 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRD2P25440 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRD2P25440 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRD2P25440 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms