Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCND1P24385 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCND1P24385 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCND1P24385 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCND1P24385 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCND1P24385 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCND1P24385 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCND1P24385 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCND1P24385 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCND1P24385 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCND1P24385 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCND1P24385 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCND1P24385 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCND1P24385 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCND1P24385 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCND1P24385 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCND1P24385 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCND1P24385 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCND1P24385 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCND1P24385 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCND1P24385 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCND1P24385 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCND1P24385 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCND1P24385 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCND1P24385 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCND1P24385 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCND1P24385 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCND1P24385 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCND1P24385 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCND1P24385 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCND1P24385 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCND1P24385 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCND1P24385 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCND1P24385 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCND1P24385 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCND1P24385 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCND1P24385 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCND1P24385 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCND1P24385 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCND1P24385 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCND1P24385 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCND1P24385 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCND1P24385 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCND1P24385 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCND1P24385 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCND1P24385 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCND1P24385 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCND1P24385 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCND1P24385 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCND1P24385 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCND1P24385 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCND1P24385 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCND1P24385 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCND1P24385 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCND1P24385 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCND1P24385 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCND1P24385 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCND1P24385 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCND1P24385 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCND1P24385 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCND1P24385 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCND1P24385 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCND1P24385 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCND1P24385 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCND1P24385 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCND1P24385 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCND1P24385 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCND1P24385 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCND1P24385 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCND1P24385 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCND1P24385 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCND1P24385 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCND1P24385 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCND1P24385 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCND1P24385 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCND1P24385 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCND1P24385 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCND1P24385 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCND1P24385 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCND1P24385 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCND1P24385 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCND1P24385 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCND1P24385 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCND1P24385 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCND1P24385 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCND1P24385 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCND1P24385 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCND1P24385 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCND1P24385 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCND1P24385 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCND1P24385 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCND1P24385 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCND1P24385 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCND1P24385 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCND1P24385 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCND1P24385 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCND1P24385 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCND1P24385 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCND1P24385 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCND1P24385 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms