Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PAX3P23760 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PAX3P23760 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PAX3P23760 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PAX3P23760 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PAX3P23760 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PAX3P23760 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PAX3P23760 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PAX3P23760 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PAX3P23760 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PAX3P23760 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PAX3P23760 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PAX3P23760 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PAX3P23760 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PAX3P23760 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PAX3P23760 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PAX3P23760 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PAX3P23760 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PAX3P23760 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PAX3P23760 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PAX3P23760 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PAX3P23760 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PAX3P23760 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PAX3P23760 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PAX3P23760 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PAX3P23760 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PAX3P23760 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PAX3P23760 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PAX3P23760 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PAX3P23760 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PAX3P23760 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PAX3P23760 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PAX3P23760 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PAX3P23760 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PAX3P23760 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PAX3P23760 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PAX3P23760 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PAX3P23760 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PAX3P23760 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PAX3P23760 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PAX3P23760 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PAX3P23760 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PAX3P23760 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PAX3P23760 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PAX3P23760 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PAX3P23760 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PAX3P23760 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PAX3P23760 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PAX3P23760 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PAX3P23760 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PAX3P23760 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PAX3P23760 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PAX3P23760 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PAX3P23760 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PAX3P23760 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PAX3P23760 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PAX3P23760 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PAX3P23760 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PAX3P23760 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PAX3P23760 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PAX3P23760 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PAX3P23760 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PAX3P23760 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PAX3P23760 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PAX3P23760 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PAX3P23760 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PAX3P23760 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PAX3P23760 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PAX3P23760 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PAX3P23760 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PAX3P23760 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PAX3P23760 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PAX3P23760 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PAX3P23760 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PAX3P23760 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PAX3P23760 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PAX3P23760 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PAX3P23760 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PAX3P23760 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PAX3P23760 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PAX3P23760 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PAX3P23760 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PAX3P23760 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PAX3P23760 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PAX3P23760 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PAX3P23760 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PAX3P23760 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PAX3P23760 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PAX3P23760 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PAX3P23760 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PAX3P23760 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PAX3P23760 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PAX3P23760 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAX3P23760 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PAX3P23760 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAX3P23760 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAX3P23760 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAX3P23760 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAX3P23760 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAX3P23760 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms