Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ME2P23368 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ME2P23368 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ME2P23368 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ME2P23368 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ME2P23368 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ME2P23368 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ME2P23368 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ME2P23368 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ME2P23368 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ME2P23368 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ME2P23368 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ME2P23368 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ME2P23368 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ME2P23368 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ME2P23368 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ME2P23368 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ME2P23368 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ME2P23368 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ME2P23368 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ME2P23368 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ME2P23368 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ME2P23368 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ME2P23368 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ME2P23368 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ME2P23368 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ME2P23368 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ME2P23368 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ME2P23368 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ME2P23368 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ME2P23368 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ME2P23368 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ME2P23368 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ME2P23368 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ME2P23368 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ME2P23368 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ME2P23368 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ME2P23368 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ME2P23368 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ME2P23368 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ME2P23368 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ME2P23368 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ME2P23368 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ME2P23368 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME2P23368 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ME2P23368 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ME2P23368 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ME2P23368 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ME2P23368 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ME2P23368 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ME2P23368 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ME2P23368 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ME2P23368 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ME2P23368 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ME2P23368 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ME2P23368 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ME2P23368 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ME2P23368 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ME2P23368 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ME2P23368 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ME2P23368 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ME2P23368 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ME2P23368 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ME2P23368 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ME2P23368 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ME2P23368 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ME2P23368 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ME2P23368 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ME2P23368 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ME2P23368 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ME2P23368 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ME2P23368 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ME2P23368 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ME2P23368 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ME2P23368 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ME2P23368 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ME2P23368 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ME2P23368 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ME2P23368 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ME2P23368 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ME2P23368 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ME2P23368 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ME2P23368 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ME2P23368 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ME2P23368 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ME2P23368 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ME2P23368 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ME2P23368 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ME2P23368 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ME2P23368 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ME2P23368 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ME2P23368 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME2P23368 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME2P23368 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME2P23368 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME2P23368 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME2P23368 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME2P23368 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ME2P23368 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ME2P23368 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms