Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBG1P23258 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBG1P23258 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBG1P23258 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBG1P23258 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBG1P23258 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBG1P23258 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBG1P23258 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBG1P23258 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBG1P23258 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBG1P23258 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBG1P23258 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBG1P23258 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBG1P23258 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBG1P23258 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBG1P23258 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBG1P23258 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBG1P23258 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBG1P23258 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBG1P23258 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBG1P23258 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBG1P23258 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBG1P23258 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBG1P23258 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBG1P23258 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBG1P23258 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBG1P23258 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBG1P23258 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBG1P23258 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBG1P23258 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBG1P23258 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBG1P23258 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBG1P23258 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBG1P23258 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBG1P23258 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBG1P23258 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBG1P23258 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBG1P23258 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBG1P23258 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBG1P23258 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBG1P23258 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBG1P23258 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBG1P23258 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBG1P23258 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBG1P23258 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBG1P23258 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBG1P23258 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBG1P23258 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBG1P23258 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBG1P23258 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBG1P23258 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBG1P23258 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBG1P23258 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBG1P23258 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBG1P23258 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBG1P23258 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBG1P23258 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBG1P23258 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBG1P23258 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBG1P23258 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBG1P23258 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBG1P23258 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBG1P23258 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBG1P23258 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBG1P23258 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBG1P23258 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBG1P23258 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBG1P23258 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBG1P23258 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBG1P23258 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBG1P23258 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBG1P23258 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBG1P23258 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBG1P23258 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBG1P23258 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBG1P23258 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBG1P23258 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBG1P23258 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBG1P23258 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBG1P23258 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBG1P23258 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBG1P23258 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBG1P23258 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBG1P23258 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBG1P23258 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBG1P23258 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBG1P23258 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBG1P23258 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBG1P23258 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBG1P23258 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBG1P23258 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBG1P23258 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBG1P23258 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBG1P23258 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBG1P23258 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBG1P23258 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBG1P23258 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBG1P23258 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBG1P23258 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBG1P23258 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms