Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCMT1P22061 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCMT1P22061 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCMT1P22061 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCMT1P22061 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCMT1P22061 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCMT1P22061 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCMT1P22061 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCMT1P22061 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCMT1P22061 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCMT1P22061 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCMT1P22061 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCMT1P22061 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCMT1P22061 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCMT1P22061 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCMT1P22061 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCMT1P22061 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCMT1P22061 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCMT1P22061 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCMT1P22061 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCMT1P22061 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCMT1P22061 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCMT1P22061 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCMT1P22061 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCMT1P22061 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCMT1P22061 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCMT1P22061 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCMT1P22061 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCMT1P22061 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCMT1P22061 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCMT1P22061 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCMT1P22061 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCMT1P22061 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCMT1P22061 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCMT1P22061 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCMT1P22061 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCMT1P22061 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCMT1P22061 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCMT1P22061 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCMT1P22061 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCMT1P22061 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCMT1P22061 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCMT1P22061 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCMT1P22061 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCMT1P22061 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCMT1P22061 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCMT1P22061 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCMT1P22061 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCMT1P22061 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCMT1P22061 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCMT1P22061 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCMT1P22061 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PCMT1P22061 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCMT1P22061 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCMT1P22061 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCMT1P22061 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCMT1P22061 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCMT1P22061 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCMT1P22061 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCMT1P22061 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCMT1P22061 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCMT1P22061 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCMT1P22061 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCMT1P22061 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCMT1P22061 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCMT1P22061 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCMT1P22061 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCMT1P22061 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCMT1P22061 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCMT1P22061 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCMT1P22061 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCMT1P22061 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCMT1P22061 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCMT1P22061 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCMT1P22061 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCMT1P22061 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCMT1P22061 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCMT1P22061 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCMT1P22061 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCMT1P22061 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCMT1P22061 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCMT1P22061 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCMT1P22061 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCMT1P22061 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCMT1P22061 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCMT1P22061 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCMT1P22061 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCMT1P22061 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCMT1P22061 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCMT1P22061 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCMT1P22061 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCMT1P22061 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCMT1P22061 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCMT1P22061 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCMT1P22061 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCMT1P22061 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCMT1P22061 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCMT1P22061 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCMT1P22061 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCMT1P22061 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms