Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK11BP21127 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK11BP21127 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK11BP21127 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK11BP21127 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK11BP21127 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK11BP21127 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CDK11BP21127 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK11BP21127 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK11BP21127 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK11BP21127 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK11BP21127 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK11BP21127 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK11BP21127 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK11BP21127 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK11BP21127 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK11BP21127 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK11BP21127 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK11BP21127 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK11BP21127 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDK11BP21127 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDK11BP21127 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDK11BP21127 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDK11BP21127 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK11BP21127 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK11BP21127 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK11BP21127 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK11BP21127 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK11BP21127 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDK11BP21127 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDK11BP21127 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDK11BP21127 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK11BP21127 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK11BP21127 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK11BP21127 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDK11BP21127 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDK11BP21127 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDK11BP21127 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK11BP21127 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK11BP21127 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK11BP21127 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK11BP21127 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK11BP21127 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK11BP21127 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK11BP21127 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK11BP21127 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK11BP21127 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK11BP21127 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK11BP21127 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK11BP21127 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK11BP21127 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK11BP21127 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK11BP21127 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK11BP21127 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDK11BP21127 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDK11BP21127 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK11BP21127 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDK11BP21127 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDK11BP21127 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK11BP21127 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK11BP21127 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK11BP21127 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK11BP21127 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK11BP21127 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK11BP21127 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK11BP21127 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK11BP21127 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK11BP21127 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDK11BP21127 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDK11BP21127 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK11BP21127 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK11BP21127 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK11BP21127 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK11BP21127 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK11BP21127 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK11BP21127 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDK11BP21127 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDK11BP21127 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDK11BP21127 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDK11BP21127 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDK11BP21127 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK11BP21127 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK11BP21127 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK11BP21127 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK11BP21127 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK11BP21127 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK11BP21127 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK11BP21127 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK11BP21127 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDK11BP21127 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK11BP21127 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK11BP21127 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK11BP21127 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK11BP21127 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK11BP21127 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK11BP21127 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK11BP21127 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK11BP21127 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK11BP21127 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK11BP21127 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms