Protein–RNA interactions for Protein: P20823

HNF1A, Hepatocyte nuclear factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1AP20823 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HNF1AP20823 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HNF1AP20823 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HNF1AP20823 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HNF1AP20823 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HNF1AP20823 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HNF1AP20823 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HNF1AP20823 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HNF1AP20823 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HNF1AP20823 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HNF1AP20823 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HNF1AP20823 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HNF1AP20823 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HNF1AP20823 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HNF1AP20823 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HNF1AP20823 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HNF1AP20823 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HNF1AP20823 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HNF1AP20823 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HNF1AP20823 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HNF1AP20823 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HNF1AP20823 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HNF1AP20823 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HNF1AP20823 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HNF1AP20823 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HNF1AP20823 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HNF1AP20823 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HNF1AP20823 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HNF1AP20823 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HNF1AP20823 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HNF1AP20823 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HNF1AP20823 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HNF1AP20823 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HNF1AP20823 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HNF1AP20823 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HNF1AP20823 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HNF1AP20823 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HNF1AP20823 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HNF1AP20823 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HNF1AP20823 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HNF1AP20823 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HNF1AP20823 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HNF1AP20823 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HNF1AP20823 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HNF1AP20823 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HNF1AP20823 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HNF1AP20823 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HNF1AP20823 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HNF1AP20823 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HNF1AP20823 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HNF1AP20823 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HNF1AP20823 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HNF1AP20823 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HNF1AP20823 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HNF1AP20823 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HNF1AP20823 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HNF1AP20823 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HNF1AP20823 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HNF1AP20823 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HNF1AP20823 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HNF1AP20823 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HNF1AP20823 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HNF1AP20823 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HNF1AP20823 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HNF1AP20823 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HNF1AP20823 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HNF1AP20823 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HNF1AP20823 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HNF1AP20823 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HNF1AP20823 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HNF1AP20823 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HNF1AP20823 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HNF1AP20823 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HNF1AP20823 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HNF1AP20823 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HNF1AP20823 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HNF1AP20823 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HNF1AP20823 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HNF1AP20823 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HNF1AP20823 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HNF1AP20823 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HNF1AP20823 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HNF1AP20823 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HNF1AP20823 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HNF1AP20823 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HNF1AP20823 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HNF1AP20823 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HNF1AP20823 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HNF1AP20823 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HNF1AP20823 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HNF1AP20823 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HNF1AP20823 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HNF1AP20823 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HNF1AP20823 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HNF1AP20823 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HNF1AP20823 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HNF1AP20823 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HNF1AP20823 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HNF1AP20823 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HNF1AP20823 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms