Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM21P19474 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM21P19474 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM21P19474 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM21P19474 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM21P19474 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM21P19474 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM21P19474 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM21P19474 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIM21P19474 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM21P19474 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM21P19474 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM21P19474 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM21P19474 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM21P19474 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM21P19474 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM21P19474 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM21P19474 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM21P19474 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM21P19474 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM21P19474 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM21P19474 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM21P19474 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM21P19474 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM21P19474 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM21P19474 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TRIM21P19474 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM21P19474 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM21P19474 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM21P19474 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM21P19474 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM21P19474 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM21P19474 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM21P19474 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM21P19474 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM21P19474 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM21P19474 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM21P19474 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM21P19474 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM21P19474 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM21P19474 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM21P19474 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM21P19474 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM21P19474 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM21P19474 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM21P19474 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM21P19474 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM21P19474 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM21P19474 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM21P19474 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM21P19474 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM21P19474 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM21P19474 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM21P19474 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM21P19474 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM21P19474 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM21P19474 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM21P19474 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM21P19474 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM21P19474 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM21P19474 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM21P19474 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM21P19474 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM21P19474 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM21P19474 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM21P19474 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM21P19474 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM21P19474 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRIM21P19474 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRIM21P19474 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRIM21P19474 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM21P19474 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM21P19474 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM21P19474 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM21P19474 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM21P19474 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM21P19474 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM21P19474 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM21P19474 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM21P19474 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM21P19474 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM21P19474 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM21P19474 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM21P19474 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM21P19474 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM21P19474 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM21P19474 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM21P19474 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM21P19474 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM21P19474 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM21P19474 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM21P19474 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM21P19474 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM21P19474 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM21P19474 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM21P19474 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM21P19474 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM21P19474 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM21P19474 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM21P19474 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms