Protein–RNA interactions for Protein: P18848

ATF4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF4P18848 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATF4P18848 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATF4P18848 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATF4P18848 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATF4P18848 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATF4P18848 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATF4P18848 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATF4P18848 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATF4P18848 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATF4P18848 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATF4P18848 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATF4P18848 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATF4P18848 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATF4P18848 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATF4P18848 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATF4P18848 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATF4P18848 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATF4P18848 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATF4P18848 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATF4P18848 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATF4P18848 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATF4P18848 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATF4P18848 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATF4P18848 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATF4P18848 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF4P18848 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF4P18848 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF4P18848 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF4P18848 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF4P18848 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF4P18848 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF4P18848 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF4P18848 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF4P18848 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF4P18848 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF4P18848 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATF4P18848 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATF4P18848 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATF4P18848 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATF4P18848 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATF4P18848 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATF4P18848 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATF4P18848 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATF4P18848 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATF4P18848 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATF4P18848 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATF4P18848 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATF4P18848 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATF4P18848 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATF4P18848 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATF4P18848 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATF4P18848 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATF4P18848 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATF4P18848 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATF4P18848 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATF4P18848 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATF4P18848 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATF4P18848 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATF4P18848 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATF4P18848 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATF4P18848 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATF4P18848 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATF4P18848 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATF4P18848 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATF4P18848 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF4P18848 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF4P18848 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF4P18848 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATF4P18848 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF4P18848 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF4P18848 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF4P18848 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF4P18848 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF4P18848 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATF4P18848 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF4P18848 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF4P18848 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF4P18848 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF4P18848 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF4P18848 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF4P18848 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF4P18848 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF4P18848 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF4P18848 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF4P18848 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF4P18848 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATF4P18848 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF4P18848 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF4P18848 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF4P18848 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF4P18848 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF4P18848 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF4P18848 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF4P18848 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF4P18848 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF4P18848 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF4P18848 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF4P18848 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF4P18848 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATF4P18848 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms