Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCC1P18754 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCC1P18754 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCC1P18754 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCC1P18754 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCC1P18754 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RCC1P18754 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RCC1P18754 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCC1P18754 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RCC1P18754 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCC1P18754 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCC1P18754 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCC1P18754 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCC1P18754 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCC1P18754 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCC1P18754 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCC1P18754 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCC1P18754 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCC1P18754 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCC1P18754 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCC1P18754 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCC1P18754 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCC1P18754 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCC1P18754 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCC1P18754 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCC1P18754 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCC1P18754 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCC1P18754 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCC1P18754 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCC1P18754 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCC1P18754 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCC1P18754 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCC1P18754 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCC1P18754 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCC1P18754 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RCC1P18754 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCC1P18754 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCC1P18754 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RCC1P18754 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCC1P18754 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCC1P18754 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCC1P18754 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCC1P18754 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RCC1P18754 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCC1P18754 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCC1P18754 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCC1P18754 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCC1P18754 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCC1P18754 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCC1P18754 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCC1P18754 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCC1P18754 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCC1P18754 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCC1P18754 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCC1P18754 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCC1P18754 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCC1P18754 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCC1P18754 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCC1P18754 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCC1P18754 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCC1P18754 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCC1P18754 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCC1P18754 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCC1P18754 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCC1P18754 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCC1P18754 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCC1P18754 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCC1P18754 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCC1P18754 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCC1P18754 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCC1P18754 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCC1P18754 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCC1P18754 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCC1P18754 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCC1P18754 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCC1P18754 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCC1P18754 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCC1P18754 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RCC1P18754 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCC1P18754 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCC1P18754 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCC1P18754 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCC1P18754 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCC1P18754 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCC1P18754 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCC1P18754 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCC1P18754 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCC1P18754 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCC1P18754 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RCC1P18754 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCC1P18754 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCC1P18754 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCC1P18754 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCC1P18754 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCC1P18754 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCC1P18754 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCC1P18754 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCC1P18754 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCC1P18754 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCC1P18754 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms