Protein–RNA interactions for Protein: P17844

DDX5, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX5P17844 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX5P17844 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX5P17844 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DDX5P17844 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX5P17844 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX5P17844 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX5P17844 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX5P17844 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX5P17844 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX5P17844 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX5P17844 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX5P17844 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX5P17844 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX5P17844 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX5P17844 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX5P17844 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX5P17844 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX5P17844 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX5P17844 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX5P17844 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX5P17844 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX5P17844 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX5P17844 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX5P17844 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX5P17844 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX5P17844 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX5P17844 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX5P17844 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDX5P17844 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX5P17844 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX5P17844 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX5P17844 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX5P17844 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX5P17844 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX5P17844 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX5P17844 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX5P17844 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX5P17844 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX5P17844 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX5P17844 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX5P17844 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX5P17844 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX5P17844 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX5P17844 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX5P17844 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX5P17844 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX5P17844 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX5P17844 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX5P17844 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX5P17844 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX5P17844 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX5P17844 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX5P17844 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX5P17844 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX5P17844 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX5P17844 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX5P17844 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX5P17844 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX5P17844 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX5P17844 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX5P17844 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX5P17844 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX5P17844 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX5P17844 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX5P17844 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX5P17844 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX5P17844 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX5P17844 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDX5P17844 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX5P17844 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX5P17844 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX5P17844 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX5P17844 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX5P17844 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX5P17844 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX5P17844 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX5P17844 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX5P17844 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX5P17844 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DDX5P17844 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX5P17844 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX5P17844 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX5P17844 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX5P17844 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX5P17844 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX5P17844 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX5P17844 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX5P17844 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX5P17844 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX5P17844 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX5P17844 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX5P17844 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX5P17844 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX5P17844 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX5P17844 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX5P17844 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX5P17844 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX5P17844 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX5P17844 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX5P17844 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms