Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MUC1P15941 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MUC1P15941 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MUC1P15941 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MUC1P15941 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MUC1P15941 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MUC1P15941 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MUC1P15941 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MUC1P15941 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MUC1P15941 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MUC1P15941 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MUC1P15941 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MUC1P15941 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MUC1P15941 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MUC1P15941 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MUC1P15941 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MUC1P15941 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MUC1P15941 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MUC1P15941 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MUC1P15941 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MUC1P15941 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MUC1P15941 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MUC1P15941 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MUC1P15941 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MUC1P15941 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MUC1P15941 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MUC1P15941 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MUC1P15941 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MUC1P15941 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MUC1P15941 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MUC1P15941 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MUC1P15941 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MUC1P15941 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MUC1P15941 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MUC1P15941 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MUC1P15941 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MUC1P15941 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MUC1P15941 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MUC1P15941 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MUC1P15941 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MUC1P15941 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MUC1P15941 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MUC1P15941 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MUC1P15941 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MUC1P15941 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MUC1P15941 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MUC1P15941 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MUC1P15941 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MUC1P15941 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MUC1P15941 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MUC1P15941 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MUC1P15941 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC1P15941 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC1P15941 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC1P15941 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC1P15941 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC1P15941 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC1P15941 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MUC1P15941 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MUC1P15941 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
MUC1P15941 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MUC1P15941 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MUC1P15941 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MUC1P15941 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC1P15941 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC1P15941 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC1P15941 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC1P15941 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC1P15941 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC1P15941 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC1P15941 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC1P15941 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MUC1P15941 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MUC1P15941 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MUC1P15941 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC1P15941 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MUC1P15941 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MUC1P15941 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MUC1P15941 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MUC1P15941 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MUC1P15941 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MUC1P15941 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MUC1P15941 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MUC1P15941 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MUC1P15941 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MUC1P15941 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MUC1P15941 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MUC1P15941 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MUC1P15941 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MUC1P15941 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MUC1P15941 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MUC1P15941 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MUC1P15941 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MUC1P15941 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MUC1P15941 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MUC1P15941 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MUC1P15941 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MUC1P15941 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MUC1P15941 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MUC1P15941 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms