Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB1P14653 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB1P14653 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB1P14653 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB1P14653 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB1P14653 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB1P14653 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB1P14653 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB1P14653 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB1P14653 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB1P14653 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB1P14653 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB1P14653 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB1P14653 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB1P14653 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB1P14653 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB1P14653 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB1P14653 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB1P14653 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXB1P14653 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB1P14653 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB1P14653 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB1P14653 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB1P14653 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB1P14653 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB1P14653 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB1P14653 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB1P14653 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB1P14653 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB1P14653 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB1P14653 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB1P14653 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB1P14653 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB1P14653 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB1P14653 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB1P14653 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB1P14653 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB1P14653 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB1P14653 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB1P14653 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB1P14653 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB1P14653 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB1P14653 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB1P14653 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB1P14653 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB1P14653 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB1P14653 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB1P14653 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB1P14653 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB1P14653 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB1P14653 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB1P14653 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB1P14653 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB1P14653 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB1P14653 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB1P14653 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB1P14653 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB1P14653 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB1P14653 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB1P14653 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB1P14653 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB1P14653 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB1P14653 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB1P14653 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB1P14653 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB1P14653 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB1P14653 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB1P14653 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB1P14653 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB1P14653 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB1P14653 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB1P14653 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB1P14653 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB1P14653 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB1P14653 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB1P14653 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB1P14653 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB1P14653 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB1P14653 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXB1P14653 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXB1P14653 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB1P14653 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB1P14653 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB1P14653 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB1P14653 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB1P14653 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB1P14653 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB1P14653 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB1P14653 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB1P14653 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB1P14653 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB1P14653 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB1P14653 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB1P14653 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB1P14653 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB1P14653 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB1P14653 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB1P14653 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB1P14653 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB1P14653 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms