Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LCP1P13796 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LCP1P13796 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LCP1P13796 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LCP1P13796 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LCP1P13796 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LCP1P13796 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LCP1P13796 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LCP1P13796 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LCP1P13796 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LCP1P13796 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LCP1P13796 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LCP1P13796 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LCP1P13796 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LCP1P13796 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LCP1P13796 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LCP1P13796 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LCP1P13796 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LCP1P13796 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LCP1P13796 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LCP1P13796 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LCP1P13796 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LCP1P13796 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LCP1P13796 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LCP1P13796 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LCP1P13796 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LCP1P13796 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LCP1P13796 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LCP1P13796 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LCP1P13796 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LCP1P13796 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LCP1P13796 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LCP1P13796 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LCP1P13796 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LCP1P13796 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LCP1P13796 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LCP1P13796 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LCP1P13796 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LCP1P13796 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LCP1P13796 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LCP1P13796 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LCP1P13796 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LCP1P13796 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LCP1P13796 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LCP1P13796 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LCP1P13796 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LCP1P13796 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LCP1P13796 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LCP1P13796 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LCP1P13796 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LCP1P13796 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LCP1P13796 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LCP1P13796 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LCP1P13796 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LCP1P13796 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LCP1P13796 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LCP1P13796 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LCP1P13796 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LCP1P13796 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LCP1P13796 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LCP1P13796 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LCP1P13796 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LCP1P13796 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LCP1P13796 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LCP1P13796 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LCP1P13796 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LCP1P13796 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LCP1P13796 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LCP1P13796 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LCP1P13796 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LCP1P13796 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LCP1P13796 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LCP1P13796 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LCP1P13796 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LCP1P13796 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LCP1P13796 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LCP1P13796 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LCP1P13796 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LCP1P13796 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LCP1P13796 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LCP1P13796 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LCP1P13796 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LCP1P13796 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LCP1P13796 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LCP1P13796 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LCP1P13796 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LCP1P13796 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LCP1P13796 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LCP1P13796 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LCP1P13796 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LCP1P13796 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LCP1P13796 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LCP1P13796 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LCP1P13796 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LCP1P13796 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LCP1P13796 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LCP1P13796 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LCP1P13796 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LCP1P13796 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LCP1P13796 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms