Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGA4P13612 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGA4P13612 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGA4P13612 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGA4P13612 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGA4P13612 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGA4P13612 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGA4P13612 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGA4P13612 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGA4P13612 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGA4P13612 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGA4P13612 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGA4P13612 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGA4P13612 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGA4P13612 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ITGA4P13612 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITGA4P13612 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ITGA4P13612 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGA4P13612 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGA4P13612 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGA4P13612 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGA4P13612 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGA4P13612 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGA4P13612 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGA4P13612 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGA4P13612 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGA4P13612 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGA4P13612 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGA4P13612 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGA4P13612 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGA4P13612 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGA4P13612 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGA4P13612 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGA4P13612 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGA4P13612 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGA4P13612 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGA4P13612 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGA4P13612 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGA4P13612 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGA4P13612 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ITGA4P13612 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGA4P13612 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGA4P13612 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGA4P13612 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ITGA4P13612 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGA4P13612 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGA4P13612 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGA4P13612 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGA4P13612 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGA4P13612 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGA4P13612 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGA4P13612 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGA4P13612 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGA4P13612 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGA4P13612 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGA4P13612 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGA4P13612 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGA4P13612 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGA4P13612 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGA4P13612 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGA4P13612 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGA4P13612 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGA4P13612 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGA4P13612 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGA4P13612 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGA4P13612 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGA4P13612 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGA4P13612 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGA4P13612 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGA4P13612 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGA4P13612 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGA4P13612 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGA4P13612 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGA4P13612 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGA4P13612 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGA4P13612 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGA4P13612 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGA4P13612 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGA4P13612 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGA4P13612 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGA4P13612 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGA4P13612 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGA4P13612 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGA4P13612 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ITGA4P13612 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGA4P13612 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGA4P13612 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGA4P13612 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGA4P13612 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGA4P13612 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGA4P13612 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGA4P13612 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGA4P13612 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGA4P13612 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ITGA4P13612 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ITGA4P13612 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ITGA4P13612 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGA4P13612 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGA4P13612 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGA4P13612 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms