Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPRP12270 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPRP12270 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPRP12270 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TPRP12270 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TPRP12270 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPRP12270 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPRP12270 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPRP12270 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPRP12270 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPRP12270 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPRP12270 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPRP12270 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TPRP12270 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TPRP12270 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TPRP12270 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPRP12270 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPRP12270 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPRP12270 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPRP12270 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPRP12270 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPRP12270 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TPRP12270 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TPRP12270 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPRP12270 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPRP12270 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPRP12270 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPRP12270 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TPRP12270 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TPRP12270 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TPRP12270 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TPRP12270 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TPRP12270 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TPRP12270 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TPRP12270 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TPRP12270 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TPRP12270 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPRP12270 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPRP12270 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPRP12270 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPRP12270 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TPRP12270 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPRP12270 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPRP12270 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TPRP12270 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPRP12270 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPRP12270 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPRP12270 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TPRP12270 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPRP12270 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPRP12270 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPRP12270 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPRP12270 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TPRP12270 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TPRP12270 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TPRP12270 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPRP12270 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPRP12270 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPRP12270 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPRP12270 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPRP12270 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPRP12270 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPRP12270 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TPRP12270 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPRP12270 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPRP12270 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPRP12270 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPRP12270 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPRP12270 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPRP12270 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TPRP12270 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPRP12270 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPRP12270 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPRP12270 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPRP12270 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPRP12270 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPRP12270 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPRP12270 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPRP12270 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPRP12270 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPRP12270 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPRP12270 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TPRP12270 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPRP12270 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPRP12270 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPRP12270 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPRP12270 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPRP12270 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPRP12270 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPRP12270 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPRP12270 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPRP12270 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TPRP12270 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPRP12270 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPRP12270 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPRP12270 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPRP12270 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPRP12270 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPRP12270 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPRP12270 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms