Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
MS4A1P11836 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
MS4A1P11836 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
MS4A1P11836 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
MS4A1P11836 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
MS4A1P11836 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
MS4A1P11836 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
MS4A1P11836 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
MS4A1P11836 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
MS4A1P11836 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
MS4A1P11836 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
MS4A1P11836 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
MS4A1P11836 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
MS4A1P11836 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
MS4A1P11836 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
MS4A1P11836 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MS4A1P11836 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
MS4A1P11836 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
MS4A1P11836 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
MS4A1P11836 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
MS4A1P11836 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
MS4A1P11836 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
MS4A1P11836 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
MS4A1P11836 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
MS4A1P11836 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
MS4A1P11836 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
MS4A1P11836 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
MS4A1P11836 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MS4A1P11836 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
MS4A1P11836 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
MS4A1P11836 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
MS4A1P11836 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
MS4A1P11836 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
MS4A1P11836 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
MS4A1P11836 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
MS4A1P11836 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
MS4A1P11836 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
MS4A1P11836 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
MS4A1P11836 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
MS4A1P11836 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
MS4A1P11836 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
MS4A1P11836 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
MS4A1P11836 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
MS4A1P11836 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
MS4A1P11836 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
MS4A1P11836 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MS4A1P11836 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MS4A1P11836 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
MS4A1P11836 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MS4A1P11836 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
MS4A1P11836 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
MS4A1P11836 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
MS4A1P11836 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
MS4A1P11836 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
MS4A1P11836 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
MS4A1P11836 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MS4A1P11836 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MS4A1P11836 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
MS4A1P11836 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
MS4A1P11836 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
MS4A1P11836 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
MS4A1P11836 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
MS4A1P11836 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
MS4A1P11836 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
MS4A1P11836 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
MS4A1P11836 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
MS4A1P11836 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
MS4A1P11836 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
MS4A1P11836 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
MS4A1P11836 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
MS4A1P11836 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.82■■■■□ 3
MS4A1P11836 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
MS4A1P11836 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
MS4A1P11836 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
MS4A1P11836 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
MS4A1P11836 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
MS4A1P11836 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
MS4A1P11836 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
MS4A1P11836 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
MS4A1P11836 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
MS4A1P11836 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
MS4A1P11836 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.77■■■■□ 3
MS4A1P11836 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
MS4A1P11836 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
MS4A1P11836 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
MS4A1P11836 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
MS4A1P11836 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
MS4A1P11836 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
MS4A1P11836 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
MS4A1P11836 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
MS4A1P11836 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
MS4A1P11836 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
MS4A1P11836 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
MS4A1P11836 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
MS4A1P11836 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
MS4A1P11836 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
MS4A1P11836 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
MS4A1P11836 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
MS4A1P11836 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
MS4A1P11836 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms