Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM225BP0DP42 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM225BP0DP42 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM225BP0DP42 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM225BP0DP42 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM225BP0DP42 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM225BP0DP42 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM225BP0DP42 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM225BP0DP42 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM225BP0DP42 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM225BP0DP42 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM225BP0DP42 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM225BP0DP42 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM225BP0DP42 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM225BP0DP42 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM225BP0DP42 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM225BP0DP42 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM225BP0DP42 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM225BP0DP42 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM225BP0DP42 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM225BP0DP42 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM225BP0DP42 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM225BP0DP42 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM225BP0DP42 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM225BP0DP42 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM225BP0DP42 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEM225BP0DP42 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM225BP0DP42 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM225BP0DP42 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM225BP0DP42 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM225BP0DP42 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM225BP0DP42 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM225BP0DP42 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM225BP0DP42 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM225BP0DP42 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM225BP0DP42 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM225BP0DP42 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM225BP0DP42 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM225BP0DP42 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM225BP0DP42 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM225BP0DP42 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM225BP0DP42 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM225BP0DP42 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM225BP0DP42 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM225BP0DP42 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM225BP0DP42 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM225BP0DP42 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM225BP0DP42 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM225BP0DP42 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM225BP0DP42 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM225BP0DP42 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM225BP0DP42 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM225BP0DP42 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM225BP0DP42 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM225BP0DP42 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM225BP0DP42 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM225BP0DP42 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM225BP0DP42 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM225BP0DP42 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM225BP0DP42 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM225BP0DP42 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM225BP0DP42 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM225BP0DP42 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM225BP0DP42 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM225BP0DP42 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM225BP0DP42 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM225BP0DP42 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM225BP0DP42 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM225BP0DP42 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM225BP0DP42 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM225BP0DP42 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM225BP0DP42 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM225BP0DP42 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM225BP0DP42 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM225BP0DP42 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM225BP0DP42 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM225BP0DP42 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM225BP0DP42 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM225BP0DP42 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM225BP0DP42 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM225BP0DP42 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM225BP0DP42 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM225BP0DP42 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM225BP0DP42 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM225BP0DP42 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM225BP0DP42 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM225BP0DP42 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM225BP0DP42 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM225BP0DP42 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM225BP0DP42 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM225BP0DP42 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM225BP0DP42 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM225BP0DP42 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM225BP0DP42 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM225BP0DP42 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM225BP0DP42 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM225BP0DP42 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM225BP0DP42 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM225BP0DP42 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM225BP0DP42 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms